地中海貧血相關(guān)基因檢測試劑注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則(2020年第16號)
發(fā)布日期:2020-03-10 閱讀量:次
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地中海貧血相關(guān)基因檢測試劑
注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則
本指導(dǎo)原則旨在指導(dǎo)注冊申請人對地中海貧血相關(guān)基因檢測試劑注冊申報資料的準(zhǔn)備及撰寫,同時也為技術(shù)審評部門對注冊申報資料的技術(shù)審評提供參考。
本指導(dǎo)原則是對地中海貧血相關(guān)基因檢測試劑的一般要求,申請人應(yīng)依據(jù)產(chǎn)品的具體特性確定其中內(nèi)容是否適用,若不適用,需具體闡述理由及相應(yīng)的科學(xué)依據(jù),并依據(jù)產(chǎn)品的具體特性對注冊申報資料的內(nèi)容進(jìn)行充實和細(xì)化。
本指導(dǎo)原則是對申請人和審查人員的指導(dǎo)性文件,但不包括注冊審批所涉及的行政事項,也不作為法規(guī)強(qiáng)制執(zhí)行,如果有能夠滿足相關(guān)法規(guī)要求的其他方法,也可以采用,但需要提供詳細(xì)的研究和驗證資料,相關(guān)人員應(yīng)在遵循法規(guī)的前提下使用本指導(dǎo)原則。
本指導(dǎo)原則是在現(xiàn)行法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)體系以及當(dāng)前認(rèn)知水平下制定的,隨著法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)的不斷完善以及科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,本指導(dǎo)原則相關(guān)內(nèi)容也將適時進(jìn)行調(diào)整。
一、適用范圍
地中海貧血(簡稱地貧)是一種常染色體隱性遺傳病,是由于珠蛋白基因發(fā)生突變(包括點突變和缺失等),致使珠蛋白肽鏈合成減少或完全不能合成而導(dǎo)致的一組單基因遺傳性溶血性疾病,輕者可無臨床表現(xiàn),重者以進(jìn)行性溶血性貧血為主要特征。根據(jù)珠蛋白肽鏈合成受到抑制的類型,地貧分為α-,β-和γ-地貧等,臨床上最常見的是α-和β-地貧。地貧主要分布在地中海沿岸、東南亞和少數(shù)非洲地區(qū),具有明顯的種族特性和地域分布差異。地貧是我國南方地區(qū)最常見、危害最大的遺傳病之一,尤以廣西、云南、廣東、海南、四川和貴州等省份為甚,云南、海南和廣東的地貧基因人群攜帶率可達(dá)10%以上,廣西更是達(dá)到了20%以上。
α-地貧主要是由于α-珠蛋白基因發(fā)生突變而引起。α-珠蛋白基因簇位于16p13.3,包括胎兒期和成人期表達(dá)的2個基因(α2和α1),基因的排列順序為5’-α2-α1-3’。根據(jù)單倍型的情況,可將α地貧分為3類:(1)缺失型α+地貧(-α/),缺失1個α基因;(2)缺失型α0地貧(--/),2個α基因同時缺失;(3)非缺失型α+地貧(αTα/或ααT/ ),1個α1或α2基因發(fā)生點突變或少數(shù)幾個堿基的缺失。中國現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)至少19種α-珠蛋白基因大片段缺失和38種α-珠蛋白基因點突變。其中,6 種α-珠蛋白基因的突變:--SEA/、-α3.7/、-α4.2/、αWSα/(HBA2:c.369C>G)、αQSα/(HBA2:c.377 T>C);αCSα/(HBA2:c.427T>C)占患病人群總數(shù)的98%。
α-地貧基因型和臨床分型的關(guān)系已經(jīng)基本闡明。α-地貧的表型嚴(yán)重程度隨著功能性α-珠蛋白基因的減少而加重:(1)1個α-基因缺失或點突變(-α/αα或ααT/αα或αTα/αα),稱為靜止型α-地貧,通常不貧血,血液學(xué)表現(xiàn)為小細(xì)胞低色素;(2)2個α-基因缺失或復(fù)合-α基因點突變,或點突變,其基因型為--/αα或-α/-α或-α/ααT或αTα/-α或αTα/αTα,稱為輕型α-地貧,臨床表現(xiàn)為不貧血或輕度貧血,血液學(xué)檢查有小細(xì)胞低色素特征;(3)3個α-基因缺失或復(fù)合α基因點突變,基因型為--/-α或--/αTα,稱為中間型α-地貧,又稱Hb H病,患者有輕至重度貧血。某些基因型為αTα/αTα的病例(如αCSα/αCSα、αQSα/αQSα和αCSα/αQSα)也表現(xiàn)為Hb H病。通常,--/αTα的非缺失型 Hb H病較單純?nèi)笔虷b H?。?-/-α)的臨床表現(xiàn)更為嚴(yán)重,特別是基因型為--/αCSα或--/αQSα的Hb H病患者,貧血程度較為嚴(yán)重;(4)4個α-基因缺失,其基因型為--/--,稱為重型α-地貧,又稱Hb Bart’s胎兒水腫綜合征,此類個體一般無法存活到出生或分娩后半小時內(nèi)死亡。
β-地貧是由于β-珠蛋白基因發(fā)生突變而引起,以點突變?yōu)橹?,少?shù)為缺失型。β-珠蛋白基因簇位于11p15.3,包括2個成人期表達(dá)基因(β和δ),基因的排列順序為5’-δ-β-3’。根據(jù)β-珠蛋白鏈合成量的程度,可將β-地貧分為3類:(1)β0地貧,β-珠蛋白鏈完全不能合成,其所在的等位基因稱為β0地貧等位基因;(2)β+地貧,β-珠蛋白鏈合成減少,其所在的等位基因稱為β+地貧等位基因;(3)β++地貧,又稱沉默型β-地貧,β-珠蛋白鏈合成輕微減少。中國已至少報道84種β-珠蛋白基因點突變和11種β-珠蛋白基因缺失。其中,6種點突變:HBB:c.126_129delCTTT,HBB:c.52A>T,HBB:c.-78A>G,HBB: c.79G>A,HBB: c.316-197C>T和HBB: c.216_217insA占了全部突變類型的90%以上。
β-地貧的臨床表型可分為4種:(1)靜止型β-地貧,基因型為β++/βN,血液學(xué)表型正?;蚺R界,一般只能通過分子診斷識別;(2)輕型β-地貧,基因型為β0/βN或β+/βN,臨床表現(xiàn)為小細(xì)胞低色素和HbA2值升高;(3)中間型β-地貧,基因型為β+/β+或β+/β0,表型變異范圍大,可從輕度貧血到中度貧血,多于幼兒期出現(xiàn)中度貧血;(4)重型β-地貧,基因型為β+/β0或β0/β0,通常伴有嚴(yán)重貧血,需要定期輸血才能存活?;純撼錾鷷r無癥狀,常于嬰兒期(3-12月齡)發(fā)病。如不治療,患兒多于5歲前死亡。此外,中間型的分子基礎(chǔ)較為復(fù)雜,顯性β-地貧突變的雜合子(βD/βN),合并α-地貧突變的β-地貧突變純合子(β0/β0),或合并α-珠蛋白三聯(lián)體的β-地貧突變雜合子(β0/βN或β+/βN),也會顯示中間型的表型。
2018年發(fā)布的《重型β-地中海貧血的診斷和治療指南》明確規(guī)定:對于重型β-地中海貧血的診斷,有條件者均應(yīng)進(jìn)行基因診斷,基因型為純合子或雙重雜合子為確診本病的指標(biāo)。2018年發(fā)布的《兒童非輸血依賴型地中海貧血的診治和管理專家共識》也明確規(guī)定:地貧基因檢測為非輸血依賴型地貧的診斷依據(jù)之一。
另外,國家衛(wèi)生健康委員會發(fā)布的相關(guān)文件要求:為減少重型地貧患兒出生,在我國地貧高發(fā)省份實施地貧防控試點項目。主要流程包括:(1)對新婚夫婦和計劃懷孕夫婦在懷孕前或孕期進(jìn)行血常規(guī)初篩;(2)對夫婦一方或雙方血常規(guī)檢查結(jié)果陽性的夫婦進(jìn)行血紅蛋白分析復(fù)篩;(3)對血紅蛋白分析復(fù)篩結(jié)果均為陽性的夫婦,取其抗凝靜脈全血進(jìn)行相應(yīng)的α+β地貧基因檢測;(4)綜合夫婦雙方病史詢問、地貧篩查和基因檢測結(jié)果,判定為高風(fēng)險夫婦。對高風(fēng)險夫婦進(jìn)行追蹤,及時了解受檢婦女懷孕情況,指導(dǎo)女方在懷孕后適宜時期接受產(chǎn)前診斷。產(chǎn)前診斷的對象為胎兒,樣本類型為胎兒的絨毛、羊水和臍帶血,檢測項目為相應(yīng)的地貧基因檢測。
綜上,結(jié)合該類產(chǎn)品臨床使用的實際情況,本指導(dǎo)原則的預(yù)期用途可為:用于體外定性檢測人外周靜脈全血或胎兒羊水等樣本中基因組DNA的α-和/或β-地貧相關(guān)基因,用于α-和/或β-地貧的輔助診斷(遺傳診斷),地貧高風(fēng)險夫婦的評估,或胎兒的產(chǎn)前遺傳診斷等。
結(jié)合該類產(chǎn)品在中國注冊的實際情況以及當(dāng)前的認(rèn)知,本指導(dǎo)原則僅對“α-和/或β-地貧的輔助診斷(遺傳診斷)”預(yù)期用途的相關(guān)內(nèi)容進(jìn)行了詳細(xì)闡述。針對其他預(yù)期用途,本指導(dǎo)原則僅對部分內(nèi)容進(jìn)行了闡述,申請人應(yīng)根據(jù)產(chǎn)品特性,對本指導(dǎo)原則未涉及的內(nèi)容進(jìn)行補(bǔ)充并做出相應(yīng)評價。
本指導(dǎo)原則的技術(shù)要求是基于PCR探針法方法建立的,對于其他分子生物學(xué)檢測技術(shù)(如:PCR-反向點雜交法和gap-PCR法等),可能部分要求不完全適用或本文所述技術(shù)指標(biāo)不夠全面,申請人可以根據(jù)產(chǎn)品特性對不適用部分進(jìn)行或補(bǔ)充其他的評價和驗證,但需闡述不適用的理由,并驗證替代方法的科學(xué)合理性。
本指導(dǎo)原則適用于進(jìn)行首次注冊申報和相關(guān)許可事項變更的產(chǎn)品。
二、注冊申報資料要求
(一)綜述資料
綜述資料主要包括產(chǎn)品預(yù)期用途、產(chǎn)品描述、有關(guān)生物安全性的說明、研究結(jié)果的總結(jié)評價以及國內(nèi)外同類產(chǎn)品上市情況介紹等內(nèi)容。其中,同類產(chǎn)品上市情況介紹部分應(yīng)著重從方法學(xué)、檢驗原理、檢測的突變類型以及臨床意義等方面詳細(xì)說明申報產(chǎn)品與目前市場上已獲批準(zhǔn)的同類產(chǎn)品之間的主要區(qū)別。
綜述資料應(yīng)符合《體外診斷試劑注冊管理辦法》(原總局令第5號,以下簡稱《辦法》)和《關(guān)于公布體外診斷試劑注冊申報資料要求和批準(zhǔn)證明文件格式的公告》(原總局公告2014年第44號),以下簡稱《44號公告》的要求。
(二)主要原材料的研究資料
主要原材料研究資料包括主要反應(yīng)成分、對照品(質(zhì)控品)及企業(yè)參考品的研究資料。
1. 此類產(chǎn)品的主要反應(yīng)成分一般包括人基因組核酸提取/純化試劑、檢測所需引物、探針、酶、dNTPs、反應(yīng)緩沖液等。申請人應(yīng)提交相關(guān)原材料的選擇、制備和質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)等的研究資料。如為申請人自制,應(yīng)提交詳細(xì)的工藝穩(wěn)定性研究資料;如為外購,還應(yīng)提交供應(yīng)商篩選資料以及供應(yīng)商提供的原材料質(zhì)量檢定報告。
1.1 核酸提取/純化試劑(如有)的主要組成、原理介紹及相關(guān)的驗證資料。
1.2 引物、探針
申請人應(yīng)詳述引物、探針的設(shè)計原則,提供引物、探針核酸序列、模板核酸序列及兩者的對應(yīng)情況。建議設(shè)計多套引物探針以供篩選,針對待測位點的特異性等進(jìn)行評價,選擇最佳設(shè)計,并提交詳細(xì)的篩選研究數(shù)據(jù)。
申請人應(yīng)針對選定的引物、探針原材料進(jìn)行質(zhì)量評價,一般包括:分子量、純度(HPLC等)、濃度、探針熒光標(biāo)記基團(tuán)的激發(fā)波長和發(fā)射波長,以及功能性試驗等,并依據(jù)評價結(jié)果建立合理的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。
1.3酶
酶包括DNA聚合酶和尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG/UNG)等。申請人應(yīng)針對各種酶的活性進(jìn)行驗證,提交功能性試驗資料,并確定酶的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。
DNA聚合酶應(yīng)具有DNA聚合酶活性,無核酸內(nèi)切酶活性,具熱穩(wěn)定性。UDG/UNG應(yīng)具有水解尿嘧啶糖苷鍵的活性,無核酸外切酶及核酸內(nèi)切酶活性。
1.4脫氧核糖核苷三磷酸(dNTPs)
包括dATP、dCTP、dGTP、dTTP或dUTP;應(yīng)提交對其純度、濃度、保存穩(wěn)定性等的驗證資料,以及功能性試驗資料,并確定質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。
2. 對照品(質(zhì)控品)
試劑盒的質(zhì)控體系通過設(shè)置各種試劑盒對照品(質(zhì)控品)來實現(xiàn)。陽性對照應(yīng)至少包括代表性的突變位點和突變類型。陰性對照可以是含有野生型序列的核酸溶液??瞻讓φ諡椴缓怂岬娜芤?。
如該類產(chǎn)品所采用的方法學(xué)和檢驗原理顯示:無論檢測何種樣本(野生型、雜合突變和純合突變),其反應(yīng)體系均可報出核酸序列結(jié)果,均可對管內(nèi)抑制導(dǎo)致的假陰性結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制,則無需另外設(shè)置內(nèi)標(biāo);否則,試劑盒應(yīng)另外設(shè)置內(nèi)標(biāo)。
對照品可采用人基因組DNA、細(xì)胞系或質(zhì)粒等。空白對照應(yīng)參與樣本核酸的平行提取。申請人應(yīng)提供對照品原料選擇、制備、定值過程等的詳細(xì)研究數(shù)據(jù),并對其檢測結(jié)果做出明確的范圍要求。
3. 企業(yè)參考品
企業(yè)參考品主要包括陽性參考品、陰性參考品、檢測限參考品和精密度參考品等。申請人應(yīng)提交企業(yè)參考品的原料選擇、制備方法、基因序列確認(rèn)及檢驗標(biāo)準(zhǔn)的詳細(xì)研究資料等。
3.1 陽性參考品:可采用臨床樣本或其核酸溶液,如采用臨床樣本,則樣本類型應(yīng)與待測樣本一致。應(yīng)至少包含所有檢測位點的雜合型樣本,同時盡量納入純合突變型樣本。對于某些稀有基因型,也可采用細(xì)胞系或質(zhì)粒。
3.2 陰性參考品:應(yīng)包括野生型臨床樣本或其核酸溶液,以及易產(chǎn)生交叉反應(yīng)的同源序列樣本,同時應(yīng)盡量包含檢測范圍外其他檢測位點的樣本等。
3.3檢測限參考品可選擇最低檢測限濃度(例如:95%檢出率水平)或接近最低檢測限濃度(例如100%檢出率水平)的臨床樣本或其核酸溶液,至少包含所有檢測位點的雜合型樣本。
3.4 精密度參考品應(yīng)至少包括低濃度雜合突變型臨床樣本或其核酸溶液,應(yīng)至少包括代表性的突變位點和突變類型,且在每一反應(yīng)體系均有分布。
目前,該類產(chǎn)品已有國家參考品,對于申報產(chǎn)品所聲稱的檢測位點,企業(yè)參考品的要求應(yīng)不低于國家參考品。
(三)主要生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系的研究資料
主要生產(chǎn)工藝研究資料包括工作液配制(引物、探針濃度、酶濃度、dNTPs濃度、緩沖液離子濃度等)、分裝和凍干(如有)、熒光標(biāo)記(如有)等工藝過程的描述及確定依據(jù)。生產(chǎn)過程應(yīng)對關(guān)鍵參數(shù)進(jìn)行有效控制,可采用流程圖方式描述生產(chǎn)工藝,標(biāo)明關(guān)鍵工藝質(zhì)控步驟,并詳細(xì)說明該步驟的質(zhì)控方法及質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)。
反應(yīng)體系研究指反應(yīng)條件的選擇確定過程,包括樣本采集、預(yù)處理(如有)、樣本用量、試劑用量、核酸提取純化步驟、PCR反應(yīng)條件、閾值循環(huán)數(shù)(Ct值)等的確定。
不同適用機(jī)型的反應(yīng)條件如有差異應(yīng)分別提交。
(四)分析性能評估資料
申請人應(yīng)針對下述各項分析性能提交詳細(xì)的評估資料,包括試驗地點、適用儀器、試劑規(guī)格、批號、試驗方法、試驗樣本(類型、來源、數(shù)量、處理方法、基因型和濃度確認(rèn)等)、可接受標(biāo)準(zhǔn)、統(tǒng)計方法、試驗數(shù)據(jù)及結(jié)論等。分析性能評估的實驗方法可以參考國內(nèi)外有關(guān)體外診斷產(chǎn)品性能評估的指導(dǎo)原則。
每項性能評估應(yīng)盡量采用與適用樣本類型一致的臨床樣本,對于某些稀有基因型,也可采用細(xì)胞系等。
1. 核酸提取/純化性能(如有)
在進(jìn)行靶核酸檢測前,應(yīng)有適當(dāng)?shù)暮怂崽崛?純化步驟。該步驟應(yīng)最大量分離和純化目的核酸并盡可能去除PCR抑制物。無論檢測試劑是否含有核酸提取/純化組分,申請人都應(yīng)對配套使用的核酸提取/純化方法的提取效率和提取核酸純度、濃度等做充分的驗證,并評價該方法能否滿足該類產(chǎn)品的要求。
2. 檢測準(zhǔn)確性
建議采用若干份臨床樣本驗證該類產(chǎn)品的檢測準(zhǔn)確性,樣本類型與說明書聲稱的樣本類型一致。樣本應(yīng)涵蓋野生型、所有檢測位點的雜合突變型,同時盡量納入純合突變型。對于某些稀有基因型,也可采用細(xì)胞系或質(zhì)粒。
3. 最低檢測限
該類產(chǎn)品的最低檢測限可定義為:在滿足一定的檢測準(zhǔn)確性和精密度的條件下,能夠檢出目標(biāo)序列的最低人基因組DNA的濃度??刹捎锰荻葷舛鹊娜嘶蚪MDNA樣本進(jìn)行多次重復(fù)檢測,確定適當(dāng)檢出率水平(如:95%)下的最低人基因組DNA濃度。檢測限評價建議采用臨床樣本或細(xì)胞系,并至少包含所有檢測位點的雜合突變型。應(yīng)明確臨床樣本或細(xì)胞系與人基因組DNA濃度的對應(yīng)關(guān)系。
4. 分析特異性
4.1 應(yīng)針對同源序列或檢測范圍外基因和位點進(jìn)行交叉反應(yīng)驗證,說明交叉反應(yīng)樣本的制備方法、核酸序列確認(rèn)方法,提交詳細(xì)的驗證資料。
4.2 應(yīng)針對可能的內(nèi)源和外源性干擾物進(jìn)行干擾試驗研究。內(nèi)源干擾物主要涉及血脂、膽紅素、血紅蛋白和白蛋白、母體細(xì)胞的干擾等,外源干擾物主要包括血液樣本采集可能用到的抗凝劑和常用藥物等。
干擾試驗可通過在臨床樣本中人工添加干擾物質(zhì)的方式,評價干擾物質(zhì)對目標(biāo)序列檢測的影響,也可直接采集暴露于干擾因素后的受試者樣本,進(jìn)行干擾試驗評價。建議申請人在每種干擾物質(zhì)的潛在最大濃度(“最差條件”)條件下進(jìn)行評價;如有干擾,應(yīng)確定不產(chǎn)生干擾的最高濃度。
5. 精密度
精密度評價應(yīng)采用臨床樣本進(jìn)行試驗,試驗操作完全按照說明書執(zhí)行,包含核酸提取/純化等步驟(如有)。應(yīng)對每一反應(yīng)體系進(jìn)行精密度評價,并至少覆蓋代表性的突變位點和突變類型。
精密度評價需滿足如下要求:
5.1對可能影響檢測精密度的主要因素進(jìn)行驗證,除檢測試劑本身外,還包括分析儀器、操作者、地點、時間、檢測輪次和試劑批次等。
5.2設(shè)定合理的精密度評價周期,對批內(nèi)/批間、日內(nèi)/日間以及不同操作者之間的精密度進(jìn)行綜合評價。如有條件,申請人應(yīng)選擇不同的實驗室進(jìn)行重復(fù)實驗以對室間重復(fù)性進(jìn)行評價。
5.3用于精密度評價的臨床樣本至少設(shè)置低濃度和中/高濃度水平。
5.4精密度指標(biāo)可設(shè)置為CV等(如有),申請人應(yīng)對精密度指標(biāo)評價標(biāo)準(zhǔn)做出合理要求。
(五)陽性判斷值確定資料
建議納入一定數(shù)量的臨床樣本,應(yīng)包括所有檢測位點的各種基因型(野生型、雜合突變型,同時盡量納入純合突變型),采用受試者工作特征(ROC)曲線或其他合理方法確定陽性判斷值。
如試劑判讀存在灰區(qū),應(yīng)解釋說明灰區(qū)范圍的確定方法。
對于某些檢測方法學(xué),陽性判斷值研究可能不適用,申請人應(yīng)說明理由。
(六)穩(wěn)定性研究資料
穩(wěn)定性研究資料主要包括申報產(chǎn)品的穩(wěn)定性研究和適用樣本的穩(wěn)定性研究兩部分。前者主要包括申報產(chǎn)品的實時穩(wěn)定性、開瓶/復(fù)溶穩(wěn)定性、運(yùn)輸穩(wěn)定性及凍融次數(shù)限制的研究等;后者則是指適用樣本的保存條件和保存時間等的研究。
實時穩(wěn)定性研究應(yīng)采用至少三批樣品在實際儲存條件下保存至成品有效期后,選取多個時間點進(jìn)行產(chǎn)品性能評價,從而確定產(chǎn)品保存條件和有效期。
如核酸提取液可保存,還需對核酸提取液的保存條件和保存時間進(jìn)行研究。
(七)臨床試驗
應(yīng)滿足《體外診斷試劑臨床試驗技術(shù)指導(dǎo)原則》(原國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第16號)的要求,如相關(guān)法規(guī)、文件有更新,臨床試驗應(yīng)符合更新后的要求。下面僅說明該類產(chǎn)品臨床試驗中應(yīng)關(guān)注的重點問題。
1.針對“α-和/或β-地貧的輔助診斷(遺傳診斷)”預(yù)期用途
1.1 臨床試驗機(jī)構(gòu)及人員
申請人應(yīng)根據(jù)產(chǎn)品特點及預(yù)期用途,綜合不同地區(qū)人種和流行病學(xué)背景等因素,選擇不少于3家(含3家)符合法規(guī)要求的臨床試驗機(jī)構(gòu)開展臨床試驗。
1.2 臨床試驗適用人群和臨床樣本
具有地貧癥狀和/或體征,或血液學(xué)表現(xiàn)為小細(xì)胞低色素的疑似地貧患者和攜帶者;需與地貧進(jìn)行鑒別診斷的其他疾病患者,如:缺鐵性貧血、鐵粒細(xì)胞性貧血或先天性紅細(xì)胞生成異常性貧血等。
臨床試驗所用樣本應(yīng)為抗凝外周血樣本(基因組DNA非臨床樣本)。臨床樣本的采集、處理、保存和提取等應(yīng)分別滿足申報產(chǎn)品說明書、對比試劑說明書(如適用)及第三方試劑說明書(如適用)的相關(guān)要求。
1.3臨床試驗方法
1.3.1已有同類產(chǎn)品上市的申報產(chǎn)品
對于已批準(zhǔn)的α-地貧突變和β-地貧突變,原則上選擇已上市同類產(chǎn)品作為對比試劑,評價申報產(chǎn)品的臨床檢測性能。
1.3.2無同類產(chǎn)品上市的申報產(chǎn)品
1.3.2.1 如新突變位點的臨床意義已獲行業(yè)認(rèn)可(如:國內(nèi)相關(guān)指南或?qū)<夜沧R),且上述認(rèn)可基于充分的中國人群的臨床數(shù)據(jù),則臨床試驗可選擇Sanger基因測序(針對新的點突變)或臨床普遍使用的其他公認(rèn)方法(針對其他類型的新突變位點,如缺失)作為對比方法,評價新突變位點的臨床檢測性能。除此之外,還應(yīng)提交新位點臨床意義已獲行業(yè)認(rèn)可的相關(guān)證據(jù),該部分資料可不納入臨床方案和報告。
1.3.2.2 如新突變位點的臨床意義未獲行業(yè)認(rèn)可,則臨床試驗應(yīng)包括兩個目的,新突變位點的臨床檢測性能評價和臨床意義評價。新突變位點的臨床檢測性能評價可參考1.3.2.1;新突變位點的臨床意義評價應(yīng)提交基于中國人群的充分的臨床證據(jù),證明基因型與表型的關(guān)系,如:隨訪或其他可證明基因型與表型關(guān)系的臨床驗證資料。
1.4最低樣本量和陽性例數(shù)
臨床試驗樣本量應(yīng)采用適當(dāng)?shù)慕y(tǒng)計學(xué)方法進(jìn)行估算,并詳細(xì)描述所使用統(tǒng)計方法及各參數(shù)的確定依據(jù)。
1.4.1 臨床檢測性能評價的樣本量估算
臨床檢測性能評價的樣本量估算可分為以下幾種情況。
對于常見突變位點,建議采用單組目標(biāo)值法分別估算每個突變位點臨床試驗的最低樣本量,通過陽性符合率計算所需陽性樣本的例數(shù),通過陰性符合率計算所需陰性樣本的例數(shù),同時考慮脫落情況,估算最低樣本總量。陽性符合率和陰性符合率的目標(biāo)值(臨床可接受的最低標(biāo)準(zhǔn))建議均不低于95%。
對于罕見突變位點,陰性樣本的例數(shù)可根據(jù)上述方法進(jìn)行估算,陽性樣本則應(yīng)保證一定的例數(shù)。
對于極其罕見的、且有確切臨床證據(jù)證明其臨床意義的突變位點,陰性樣本的例數(shù)可根據(jù)上述方法進(jìn)行估算,陽性樣本的例數(shù)則應(yīng)結(jié)合臨床證據(jù)確定。
1.4.2 新位點臨床意義評價的樣本量估算
新位點臨床意義評價的樣本量估算,建議采用抽樣調(diào)查公式或其他合理方法進(jìn)行估算。
2. 針對“地貧高風(fēng)險夫婦的評估”和“胎兒的產(chǎn)前遺傳診斷”預(yù)期用途
針對上述兩個預(yù)期用途,本指導(dǎo)原則僅對部分內(nèi)容進(jìn)行了闡述,申請人應(yīng)根據(jù)產(chǎn)品特性,充分考慮本指導(dǎo)原則未涉及的內(nèi)容,設(shè)計科學(xué)合理的臨床試驗并進(jìn)行評價。
2.1臨床試驗機(jī)構(gòu)和人員
如申報產(chǎn)品的預(yù)期用途為胎兒的產(chǎn)前遺傳診斷,除滿足法規(guī)要求外,臨床試驗機(jī)構(gòu)還應(yīng)取得產(chǎn)前診斷技術(shù)服務(wù)資質(zhì)。臨床試驗人員應(yīng)為經(jīng)過專門培訓(xùn)的取得資質(zhì)的人員。機(jī)構(gòu)和人員應(yīng)遵循《產(chǎn)前診斷技術(shù)管理辦法》《母嬰保健專項技術(shù)服務(wù)許可及人員資格管理辦法》,機(jī)構(gòu)應(yīng)取得《母嬰保健技術(shù)服務(wù)執(zhí)業(yè)許可證》,人員應(yīng)取得《母嬰保健技術(shù)考核合格證書》。
2.2 臨床試驗適用人群和臨床樣本
如預(yù)期用途為地貧高風(fēng)險夫婦的評估,則適用人群為:地貧表型篩查陽性的育齡人群。地貧表型篩查陽性的育齡人群可根據(jù)國家衛(wèi)生健康委員會和地貧高發(fā)地區(qū)相關(guān)政策確定。
如預(yù)期用途為胎兒的產(chǎn)前遺傳診斷,則適用人群為:地貧高風(fēng)險夫婦的胎兒。地貧高風(fēng)險夫婦的確定可參考國家衛(wèi)生健康委員會等相關(guān)文件。
臨床試驗所用樣本應(yīng)為胎兒羊水等臨床樣本(基因組DNA非臨床樣本)。臨床樣本的采集、處理、保存和提取等應(yīng)符合國家衛(wèi)生健康委員會等相關(guān)文件的要求,并滿足產(chǎn)品說明書的要求。
2.3 最低樣本量和陽性例數(shù)
針對每種不同的預(yù)期用途,應(yīng)分別采用合理方法估算最低樣本量。同一預(yù)期用途的不同樣本類型(羊水和臍帶血等),也應(yīng)分別采用合理方法估算最低樣本量。
3. 如有其他預(yù)期用途,也應(yīng)設(shè)計科學(xué)的臨床試驗,提供充分的證據(jù),證明其預(yù)期用途。
4. 不同預(yù)期用途的通用要求
4.1 臨床試驗方法、數(shù)據(jù)及統(tǒng)計分析
4.1.1應(yīng)在臨床試驗方案或報告中明確申報產(chǎn)品、對比試劑和第三方試劑的試驗方法。
4.1.2臨床試驗病例總結(jié)表應(yīng)以列表方式表示,包括申報產(chǎn)品的結(jié)果、對比試劑的結(jié)果、第三方試劑的檢測結(jié)果(如有)、臨床診斷、年齡和性別等。
4.1.3以交叉表分別總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,選擇合適的統(tǒng)計方法進(jìn)行統(tǒng)計分析,以驗證兩種試劑檢測結(jié)果的一致性。
4.1.4 結(jié)果差異樣本的驗證
在數(shù)據(jù)收集過程中,對于兩種試劑檢測結(jié)果不一致的樣本,采用合理方法進(jìn)行復(fù)核,并對差異原因進(jìn)行分析。如無需復(fù)核,應(yīng)說明理由。
4.2 臨床試驗方案
各臨床試驗機(jī)構(gòu)的方案設(shè)置應(yīng)基本一致,且保證在整個臨床試驗過程中遵循預(yù)定的方案,不可隨意改動。整個試驗過程應(yīng)在臨床試驗機(jī)構(gòu)的實驗室內(nèi)并由該實驗室的技術(shù)人員操作完成,申報單位的技術(shù)人員除進(jìn)行必要的技術(shù)指導(dǎo)外,不得隨意干涉實驗進(jìn)程。
試驗方案應(yīng)確定嚴(yán)格的入選/排除標(biāo)準(zhǔn),任何已入選的樣本被排除出臨床試驗都應(yīng)記錄在案并明確說明原因。在試驗操作過程和結(jié)果判定時,應(yīng)采用盲法以保證試驗結(jié)果的客觀性。各臨床試驗機(jī)構(gòu)選用的對比試劑/方法應(yīng)保持一致,以便進(jìn)行合理的統(tǒng)計學(xué)分析。另外,申報產(chǎn)品的樣本類型不應(yīng)超越對比試劑/方法對樣本類型的要求。
4.3臨床試驗報告
應(yīng)對試驗的整體設(shè)計及各個關(guān)鍵點給予清晰、完整的闡述,應(yīng)該對整個臨床試驗實施過程、結(jié)果分析、結(jié)論等進(jìn)行條理分明的描述,并應(yīng)包括必要的數(shù)據(jù)和統(tǒng)計分析方法。
(八)產(chǎn)品技術(shù)要求
產(chǎn)品技術(shù)要求應(yīng)符合《辦法》、《44號公告》和《醫(yī)療器械產(chǎn)品技術(shù)要求編寫指導(dǎo)原則》(原國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第9號)的相關(guān)要求。該類產(chǎn)品作為三類體外診斷試劑,應(yīng)將主要原材料、生產(chǎn)工藝及半成品要求等內(nèi)容作為附錄附于技術(shù)要求正文后。
目前,該類產(chǎn)品已有行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),產(chǎn)品技術(shù)要求的相關(guān)要求應(yīng)不低于行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的要求。
(九)產(chǎn)品檢驗報告
根據(jù)《辦法》的要求,第三類體外診斷試劑申請注冊時應(yīng)提交連續(xù)三個生產(chǎn)批次樣品的檢驗報告。目前,該產(chǎn)品已有國家參考品,產(chǎn)品檢驗應(yīng)滿足國家參考品的要求。
(十)產(chǎn)品說明書
產(chǎn)品說明書應(yīng)滿足《體外診斷試劑說明書編寫指導(dǎo)原則》(原國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第17號)的要求,產(chǎn)品說明書的所有內(nèi)容均應(yīng)與申請人提交的注冊申報資料的相關(guān)研究結(jié)果保持一致。下面對該類產(chǎn)品說明書的重點內(nèi)容進(jìn)行闡述。
1.【預(yù)期用途】應(yīng)至少包括以下幾部分內(nèi)容:
1.1本產(chǎn)品用于定性檢測人xx樣本基因組DNA中的α-和/或β-地貧xx突變,用于:α-和/或β-地貧的輔助診斷(遺傳診斷),地貧高風(fēng)險夫婦的評估,或胎兒的產(chǎn)前遺傳診斷。
1.2介紹地貧相關(guān)的臨床背景信息及實驗室診斷方法等,介紹被測靶標(biāo)(突變位點)的相關(guān)情況。
2.【主要組成成分】
2.1說明試劑盒包含組分的名稱或數(shù)量等信息,說明不同批號試劑盒中各組分是否可以互換。
2.2試劑盒中不包含但對該項檢測必須的組分,企業(yè)應(yīng)列出相關(guān)試劑/耗材的名稱及其他相關(guān)信息。
2.3如果試劑盒中不包含用于核酸提取純化的試劑組分,則應(yīng)在此注明經(jīng)過驗證后配合使用的商品化核酸提取純化試劑盒的生產(chǎn)企業(yè)、產(chǎn)品名稱以和醫(yī)療器械備案號(如有)等詳細(xì)信息。
3.【檢驗原理】
3.1對試劑盒的被測靶標(biāo)進(jìn)行詳細(xì)描述(基因位置、突變位點及相關(guān)特征等),對試劑盒所用探針、引物或突變的判定等進(jìn)行詳細(xì)介紹;對不同樣本反應(yīng)管組合、對照品設(shè)置及熒光信號檢測原理等進(jìn)行介紹。
3.2試劑盒技術(shù)原理的詳細(xì)介紹,建議結(jié)合適當(dāng)圖示進(jìn)行說明。如反應(yīng)體系中添加了相關(guān)的防污染組分(如UNG酶),也應(yīng)對其作用機(jī)理進(jìn)行適當(dāng)介紹。
4.【儲存條件及有效期】
說明試劑盒的效期穩(wěn)定性等,應(yīng)明確具體的儲存條件及有效期等信息。
5.【樣本要求】
樣本的采集、處理、運(yùn)送和保存:明確樣本采集、核酸提取純化前的處理(如離心和洗滌等)、保存條件及期限以及運(yùn)送條件等。冷藏/冷凍樣本檢測前是否需要恢復(fù)至室溫,凍融次數(shù)的限制等。
6.【適用儀器】
所有適用的儀器型號,并提供與儀器有關(guān)的重要信息以指導(dǎo)用戶操作。
7.【檢驗方法】
詳細(xì)說明實驗操作的各個步驟,包括:
7.1實驗條件:實驗室分區(qū)、實驗環(huán)境的溫度、濕度和空調(diào)氣流方向控制等注意事項。
7.2試劑配制方法和注意事項。
7.3詳述核酸提取純化的條件、步驟及注意事項(如適用),對核酸提取純化環(huán)節(jié)進(jìn)行合理質(zhì)控,明確提取核酸的濃度純度等質(zhì)量要求。
7.4擴(kuò)增反應(yīng)前準(zhǔn)備:加樣體積、順序等。
7.5 PCR各階段的溫度、時間設(shè)置、循環(huán)數(shù)設(shè)置或相應(yīng)的自動化檢測程序及相關(guān)注意事項。
7.6儀器設(shè)置(如適用):特殊參數(shù)、探針的熒光素標(biāo)記情況、對待測樣本及其他對照品的熒光通道選擇等。
8.【檢驗結(jié)果的解釋】
結(jié)合對照品、樣本管檢測結(jié)果以及檢測類型,以列表形式詳述所有可能出現(xiàn)的結(jié)果及相應(yīng)的解釋。如存在檢測灰區(qū),應(yīng)詳述對于灰區(qū)結(jié)果的處理方式。
9.【檢驗方法的局限性】
9.1申報產(chǎn)品僅對下述檢測類型xx進(jìn)行了驗證。
9.2有關(guān)假陰性結(jié)果的可能性分析
9.2.1不合理的樣本采集、運(yùn)送及處理或核酸過度降解均有可能導(dǎo)致假陰性結(jié)果。
9.2.2未經(jīng)驗證的其他干擾或PCR抑制因子等可能會導(dǎo)致假陰性結(jié)果(如有)。
10.【產(chǎn)品性能指標(biāo)】簡述以下性能指標(biāo):
10.1最低檢測限:簡單介紹最低檢測限的確定方法,并明確最低檢測限結(jié)果。
10.2陽性/陰性參考品符合率。
10.3精密度:簡單介紹精密度的確定方法,并明確精密度結(jié)果。
10.4分析特異性
10.4.1交叉反應(yīng)驗證:同源性序列等交叉反應(yīng)驗證。
10.4.2干擾物質(zhì)驗證:樣本中常見干擾物質(zhì)對檢測結(jié)果的影響。
10.5對比試驗研究(如有):簡要介紹對比試劑(方法)的信息、所采用的統(tǒng)計學(xué)方法及統(tǒng)計分析結(jié)果。
11.【注意事項】應(yīng)至少包括以下內(nèi)容:
11.1如該產(chǎn)品含有人源或動物源性物質(zhì),應(yīng)給出具有潛在感染性的警告。
11.2臨床實驗室應(yīng)嚴(yán)格按照《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增實驗室管理辦法》現(xiàn)行有效版本等有關(guān)分子生物學(xué)實驗室、臨床基因擴(kuò)增實驗室的管理規(guī)范執(zhí)行。
三、起草單位
國家藥品監(jiān)督管理局醫(yī)療器械技術(shù)審評中心。
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