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腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑技術(shù)審查指導(dǎo)原則(2014年第2號(hào))

發(fā)布日期:2014-03-13 閱讀量:

附件:腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑技術(shù)審查指導(dǎo)原則(2014年第2號(hào)).doc

腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑技術(shù)審查指導(dǎo)原則(2014年第2號(hào))(圖1)

腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑技術(shù)審查指導(dǎo)原則

本指導(dǎo)原則旨在指導(dǎo)注冊(cè)申請(qǐng)人對(duì)腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑注冊(cè)申報(bào)資料的準(zhǔn)備及撰寫,同時(shí)也為技術(shù)審評(píng)部門對(duì)注冊(cè)申報(bào)資料的技術(shù)審評(píng)提供參考。

本指導(dǎo)原則是針對(duì)腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑的一般要求,申請(qǐng)人應(yīng)依據(jù)產(chǎn)品的具體特性確定其中內(nèi)容是否適用,若不適用,需具體闡述理由及相應(yīng)的科學(xué)依據(jù),并依據(jù)產(chǎn)品的具體特性對(duì)注冊(cè)申報(bào)資料的內(nèi)容進(jìn)行充實(shí)和細(xì)化。

本指導(dǎo)原則是對(duì)申請(qǐng)人和審查人員的指導(dǎo)性文件,但不包括注冊(cè)審批所涉及的行政事項(xiàng),亦不作為法規(guī)強(qiáng)制執(zhí)行,如果有能夠滿足相關(guān)法規(guī)要求的其他方法,也可以采用,但需要詳細(xì)闡明理由,并對(duì)其科學(xué)合理性進(jìn)行驗(yàn)證,提供詳細(xì)的研究資料和驗(yàn)證資料,相關(guān)人員應(yīng)在遵循相關(guān)法規(guī)的前提下使用本指導(dǎo)原則。

本指導(dǎo)原則是在現(xiàn)行法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)體系以及當(dāng)前認(rèn)知水平下制定的,隨著法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)的不斷完善,以及科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,本指導(dǎo)原則相關(guān)內(nèi)容也將適時(shí)進(jìn)行調(diào)整。

一、范圍

本指導(dǎo)原則所述腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑是指利用基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)方法的核酸檢測(cè)技術(shù),以腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)的突變基因?yàn)闄z測(cè)目標(biāo),對(duì)人體樣本(包括組織、體液等)提取的核酸組分中的目標(biāo)序列進(jìn)行體外檢測(cè)的試劑。

本指導(dǎo)原則所指基因突變的類型包括置換、插入、缺失、基因重排、拷貝數(shù)異常及核糖核酸(RNA)表達(dá)異常等廣義的基因突變。

本指導(dǎo)原則的技術(shù)要求是基于熒光探針PCR方法確立的,對(duì)于高分辨熔解曲線PCR方法、Luminex平臺(tái)或核酸檢測(cè)芯片等其他基于PCR的分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù),可能部分要求不完全適用或本指導(dǎo)原則所述技術(shù)指標(biāo)不夠全面,申請(qǐng)人可以根據(jù)實(shí)際產(chǎn)品特性選擇適合的方法或補(bǔ)充需要的評(píng)價(jià)和驗(yàn)證,但需闡述不適用的理由,并驗(yàn)證其科學(xué)合理性,同時(shí)確認(rèn)性能評(píng)價(jià)的充分性。本指導(dǎo)原則所涉及試劑的方法學(xué)不包括熒光原位雜交(Fluorescence in situ Hybridization,F(xiàn)ISH)、核酸序列測(cè)定、染色體核型分析及免疫組化技術(shù)等用于腫瘤個(gè)體化治療指導(dǎo)的其他方法學(xué)。本指導(dǎo)原則適用于進(jìn)行首次注冊(cè)申報(bào)和相關(guān)許可事項(xiàng)變更的產(chǎn)品。

二、注冊(cè)申報(bào)資料要求

(一)綜述資料

綜述資料主要包括產(chǎn)品預(yù)期用途、產(chǎn)品描述、有關(guān)生物安全性的說(shuō)明、研究結(jié)果的總結(jié)評(píng)價(jià)以及同類產(chǎn)品上市情況介紹等內(nèi)容,其中同類產(chǎn)品上市情況介紹部分應(yīng)著重從方法學(xué)及不同基因突變類型檢出能力等方面寫明擬申報(bào)產(chǎn)品與目前市場(chǎng)上已獲批準(zhǔn)的同類產(chǎn)品之間的主要區(qū)別。若尚無(wú)同品種批準(zhǔn)上市,則應(yīng)詳細(xì)論述作為檢測(cè)靶標(biāo)的突變基因與個(gè)體化治療方案的相關(guān)性,說(shuō)明理論依據(jù)。

提交的資料應(yīng)符合《體外診斷試劑注冊(cè)管理辦法(試行)》(國(guó)食藥監(jiān)械〔2007〕229號(hào))(以下簡(jiǎn)稱《辦法》)和《體外診斷試劑注冊(cè)申報(bào)資料基本要求》(國(guó)食藥監(jiān)械〔2007〕609號(hào))的相關(guān)要求。

(二)產(chǎn)品說(shuō)明書

說(shuō)明書承載了產(chǎn)品預(yù)期用途、標(biāo)本采集及處理、實(shí)驗(yàn)方法、檢測(cè)結(jié)果解釋以及注意事項(xiàng)等重要信息,是指導(dǎo)實(shí)驗(yàn)室工作人員正確操作、臨床醫(yī)生針對(duì)檢驗(yàn)結(jié)果給出合理醫(yī)學(xué)解釋的重要依據(jù),因此,產(chǎn)品說(shuō)明書是體外診斷試劑注冊(cè)申報(bào)最重要的文件之一。產(chǎn)品說(shuō)明書的格式應(yīng)符合《體外診斷試劑說(shuō)明書編寫指導(dǎo)原則》的要求,境外試劑的中文說(shuō)明書除格式要求外,其內(nèi)容應(yīng)盡量保持與原文說(shuō)明書的一致性,翻譯力求準(zhǔn)確且符合中文表達(dá)習(xí)慣。產(chǎn)品說(shuō)明書中相關(guān)技術(shù)內(nèi)容均應(yīng)與申請(qǐng)人提交的注冊(cè)申報(bào)資料中的相關(guān)研究結(jié)果保持一致,如某些內(nèi)容引用自參考文獻(xiàn),則應(yīng)以規(guī)范格式對(duì)此內(nèi)容進(jìn)行標(biāo)注,并單獨(dú)列明文獻(xiàn)的相關(guān)信息。

結(jié)合《體外診斷試劑說(shuō)明書編寫指導(dǎo)原則》的要求,下面對(duì)腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑說(shuō)明書的重點(diǎn)內(nèi)容進(jìn)行詳細(xì)說(shuō)明,以指導(dǎo)注冊(cè)申報(bào)人員更合理地完成說(shuō)明書編制。需要強(qiáng)調(diào)的是,產(chǎn)品說(shuō)明書內(nèi)容應(yīng)與申請(qǐng)人前期完成的分析性能評(píng)估、穩(wěn)定性研究、臨床實(shí)驗(yàn)研究等技術(shù)資料完全一致。

1.【預(yù)期用途】

應(yīng)至少包括以下幾部分內(nèi)容:

1.1臨床背景的介紹,包括相關(guān)適用人群特征、腫瘤的組織類型、適用的樣本類型、待測(cè)靶基因序列的特征及選擇依據(jù),靶基因及其表達(dá)蛋白在惡性腫瘤發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中可能起到的作用,相關(guān)藥物或其他治療技術(shù)及其作用機(jī)理、與待測(cè)突變位點(diǎn)可能存在的關(guān)系等。

如申報(bào)試劑未與具體治療方案聯(lián)合進(jìn)行相應(yīng)的臨床試驗(yàn)研究,關(guān)于靶基因突變與腫瘤疾病及治療方案的相關(guān)性描述僅僅來(lái)自診療指南、書籍、文獻(xiàn)等資料,則在本項(xiàng)下應(yīng)注明參考資料的出處,預(yù)期用途的相關(guān)表述中不應(yīng)涉及具體藥物產(chǎn)品(商品)名稱、生產(chǎn)企業(yè)信息等,并注明未將該產(chǎn)品與具體藥物聯(lián)合進(jìn)行臨床試驗(yàn),僅針對(duì)靶基因突變的檢測(cè)性能進(jìn)行了驗(yàn)證;若已將試劑盒與具體藥品聯(lián)合進(jìn)行了相關(guān)臨床試驗(yàn),并證明其具有指導(dǎo)治療的臨床意義,則可在此明確具體藥物,并在說(shuō)明書中對(duì)相關(guān)的臨床研究情況進(jìn)行簡(jiǎn)介。

1.2試劑盒用于特定腫瘤患者人群,通過(guò)檢測(cè)人體樣本提取的核酸組分中是否存在靶基因突變,對(duì)臨床上特定腫瘤患者的個(gè)體化治療提供參考意見(jiàn)。腫瘤的類別及適用樣本類型應(yīng)結(jié)合實(shí)際的臨床研究完成情況進(jìn)行確認(rèn)。

1.3明確說(shuō)明該試劑盒僅用于對(duì)特定腫瘤患者靶基因序列的檢測(cè),其檢測(cè)結(jié)果僅供臨床參考,不應(yīng)作為患者個(gè)體化治療的唯一依據(jù),臨床醫(yī)生應(yīng)結(jié)合患者病情、藥物適應(yīng)癥、治療反應(yīng)及其他實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)指標(biāo)等因素對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行綜合判斷。

2.【檢驗(yàn)原理】

2.1對(duì)試劑盒檢測(cè)能夠覆蓋的所有突變位點(diǎn)或突變類型進(jìn)行詳細(xì)描述(靶序列長(zhǎng)度、基因座位、突變類型及相關(guān)特征等),對(duì)引物及探針設(shè)計(jì)、不同樣品反應(yīng)管組合、對(duì)照品設(shè)置及熒光信號(hào)檢測(cè)原理等進(jìn)行逐項(xiàng)介紹。

2.2核酸分離/純化方法、原理等。

2.3試劑盒技術(shù)原理的詳細(xì)介紹,建議結(jié)合適當(dāng)圖示進(jìn)行說(shuō)明。如添加了相關(guān)的防污染組分(如尿嘧啶DNA糖基化酶,即UDG/UNG等),也應(yīng)對(duì)其作用機(jī)理作適當(dāng)介紹。

3.【主要組成成份】

3.1詳細(xì)說(shuō)明試劑盒內(nèi)各組分的名稱、數(shù)量、內(nèi)容物、比例或濃度等信息,陰性/陽(yáng)性對(duì)照品(或質(zhì)控品)可能含有生物源性物質(zhì)的組分,應(yīng)說(shuō)明其生物學(xué)來(lái)源、活性及其他特性;說(shuō)明不同批號(hào)試劑盒中各組分是否可以互換。

3.2試劑盒中不包含但對(duì)該項(xiàng)檢測(cè)必須的組分,企業(yè)應(yīng)列出相關(guān)試劑/耗材的名稱、注冊(cè)證號(hào)(如有)及其他必要的信息。

3.3如果試劑盒中不包含用于核酸分離/純化的試劑組分,則應(yīng)在此注明經(jīng)驗(yàn)證后推薦配合使用的商品化核酸分離/純化試劑盒的生產(chǎn)企業(yè)、產(chǎn)品名稱以及該產(chǎn)品的醫(yī)療器械注冊(cè)證號(hào)(如有)等詳細(xì)信息。

4.【儲(chǔ)存條件及有效期】

試劑盒的效期穩(wěn)定性、開(kāi)瓶穩(wěn)定性、復(fù)溶穩(wěn)定性、運(yùn)輸穩(wěn)定性、凍融次數(shù)要求等。

5.【適用儀器】

所有適用的儀器型號(hào),并提供與儀器有關(guān)的重要信息以指導(dǎo)用戶操作。

6.【樣本要求】 

重點(diǎn)明確以下內(nèi)容:

6.1對(duì)適用的樣本類型作詳細(xì)介紹,包括樣本來(lái)源及取材要求、樣本處理方式(如組織樣本的固定及包埋方式)、腫瘤細(xì)胞比例等。

樣本的取材及處理方式等若有通用的技術(shù)規(guī)范或指南,則應(yīng)遵循,并在此處引用。

6.2樣本處理及保存:核酸分離/純化前樣本的預(yù)處理、保存條件及期限(短期、長(zhǎng)期)、運(yùn)輸條件等。

6.3在核酸分離/純化過(guò)程結(jié)束后,應(yīng)采用適當(dāng)方法對(duì)分離/純化后的核酸儲(chǔ)備液進(jìn)行質(zhì)量控制。比如,采用分光光度計(jì)法對(duì)分離/純化后的核酸儲(chǔ)備液進(jìn)行濃度、純度檢測(cè),并依據(jù)性能驗(yàn)證結(jié)果在此給出用于擴(kuò)增試驗(yàn)的核酸溶液濃度范圍要求。舉例:擴(kuò)增反應(yīng)終體系中需要50ng的脫氧核糖核酸(DNA)量,而在終體系中需加入25μL的DNA儲(chǔ)備液,則在DNA分離/純化完成后應(yīng)將DNA儲(chǔ)備液的濃度調(diào)整至2ng/μL的濃度。

如分離/純化后的核酸儲(chǔ)備液質(zhì)量(如濃度范圍)不符合要求,應(yīng)重新取材或擴(kuò)大樣本量再進(jìn)行核酸分離/純化。

6.4操作過(guò)程中各種制備液的穩(wěn)定性要求,如各類混合液(Mix)、DNA/RNA儲(chǔ)備液、反應(yīng)終體系等(常溫/冷藏/冷凍/凍融次數(shù)限制等)。

7.【檢驗(yàn)方法】

詳細(xì)說(shuō)明實(shí)驗(yàn)操作的各個(gè)步驟,包括:

7.1試劑配制方法、注意事項(xiàng)。

7.2詳述核酸分離/純化的條件、步驟及注意事項(xiàng)。對(duì)照品(質(zhì)控品)應(yīng)參與樣本核酸的平行提?。ㄈ缬斜匾詫?duì)核酸分離/純化環(huán)節(jié)進(jìn)行合理的質(zhì)量控制。

7.3擴(kuò)增反應(yīng)前準(zhǔn)備:各組分加樣體積、順序、相關(guān)注意事項(xiàng)等。

7.4逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程(如涉及)的溫度和時(shí)間設(shè)置、PCR各階段的溫度、時(shí)間設(shè)置、循環(huán)數(shù)設(shè)置及相關(guān)注意事項(xiàng)。

7.5儀器設(shè)置:特殊參數(shù),待測(cè)基因、內(nèi)標(biāo)和對(duì)照品的熒光通道選擇等。

8.【參考值(參考范圍)】

參考值(參考范圍)的描述包括基線的確定方法和閾值循環(huán)數(shù)(Ct)的要求(如適用)。除Ct值要求外,建議結(jié)合是否出現(xiàn)典型S形曲線對(duì)結(jié)果進(jìn)行判斷。

9.【檢驗(yàn)結(jié)果的解釋】

結(jié)合陽(yáng)性對(duì)照、陰性對(duì)照以及樣本管中靶基因和內(nèi)標(biāo)的檢測(cè)結(jié)果(Ct值),對(duì)所有可能出現(xiàn)的結(jié)果組合及相應(yīng)的解釋進(jìn)行詳述。如存在檢測(cè)灰區(qū),應(yīng)對(duì)灰區(qū)結(jié)果的處理方式一并詳述。

10.【檢驗(yàn)方法的局限性】

10.1本試劑盒的檢測(cè)結(jié)果僅供臨床參考,對(duì)患者個(gè)體化治療的選擇應(yīng)結(jié)合其癥狀/體征、病史、其他實(shí)驗(yàn)室檢查及治療反應(yīng)等情況綜合考慮。

10.2陰性結(jié)果不能完全排除靶基因突變的存在,樣本中腫瘤細(xì)胞過(guò)少、核酸過(guò)度降解或擴(kuò)增反應(yīng)體系中靶基因濃度低于檢測(cè)限亦可造成陰性結(jié)果。

10.3腫瘤組織(細(xì)胞)可能存在較大異質(zhì)性,不同部位取樣可能會(huì)得到不同的檢測(cè)結(jié)果。

10.4不合理的樣本采集、轉(zhuǎn)運(yùn)及處理,以及不當(dāng)?shù)脑囼?yàn)操作和實(shí)驗(yàn)環(huán)境均有可能導(dǎo)致假陰性或假陽(yáng)性結(jié)果。

10.5明確該檢測(cè)僅限于規(guī)定的樣本類型及檢測(cè)系統(tǒng)(包括適用機(jī)型、核酸分離/純化試劑、檢測(cè)方法等)。

11.【產(chǎn)品性能指標(biāo)】

詳述以下性能指標(biāo):

11.1對(duì)相應(yīng)國(guó)家參考品(如有)檢測(cè)的符合情況。

11.2最低檢測(cè)限:說(shuō)明在試劑盒規(guī)定的檢測(cè)條件及擴(kuò)增體系中,試劑盒能夠覆蓋的所有突變類別的最低檢出濃度,重點(diǎn)考慮原始模板中突變基因的百分率和擴(kuò)增終體系中核酸濃度兩個(gè)因素對(duì)最低檢測(cè)限的影響;并簡(jiǎn)單介紹最低檢測(cè)限的確定方法。

11.3企業(yè)內(nèi)部陽(yáng)性/陰性參考品符合率,陽(yáng)性/陰性參考品的組成、來(lái)源、濃度梯度設(shè)置以及評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)等信息。

11.4精密度:精密度參考品的組成、來(lái)源、濃度梯度要求及評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn),不同濃度精密度參考品的檢測(cè)結(jié)果(變異系數(shù))。

11.5分析特異性

11.5.1野生型驗(yàn)證:應(yīng)采用不同濃度的野生型核酸樣本進(jìn)行驗(yàn)證,其結(jié)果應(yīng)均為陰性。

11.5.2試劑盒內(nèi)交叉反應(yīng):如考核試劑包括對(duì)多個(gè)突變位點(diǎn)的檢測(cè),則應(yīng)對(duì)該試劑盒覆蓋范圍內(nèi)的所有突變類型間進(jìn)行交叉反應(yīng)驗(yàn)證。

11.5.3序列相近或具有一定同源性的其他較常見(jiàn)突變或野生型基因序列間的交叉反應(yīng)驗(yàn)證。

11.5.4潛在干擾物質(zhì)驗(yàn)證。

如果經(jīng)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)某些序列與靶序列的交叉反應(yīng)出現(xiàn)陽(yáng)性結(jié)果,則應(yīng)該對(duì)存在交叉反應(yīng)的核酸序列及濃度進(jìn)行驗(yàn)證并在產(chǎn)品說(shuō)明書中表明這種假陽(yáng)性發(fā)生的可能,做出相關(guān)的提示。

11.6對(duì)比試驗(yàn)研究(如有):簡(jiǎn)要介紹參比試劑(方法)的信息、所采用的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法及統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果。

12.【注意事項(xiàng)】

應(yīng)至少包括以下內(nèi)容:

12.1如該產(chǎn)品含有人源或動(dòng)物源性物質(zhì),應(yīng)給出具有潛在感染性的警告。

12.2臨床實(shí)驗(yàn)室應(yīng)嚴(yán)格按照《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室管理辦法》(衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā)〔2010〕194號(hào)或現(xiàn)行有效版本)等有關(guān)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室、臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室的管理規(guī)范執(zhí)行。

(三)擬定產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)及編制說(shuō)明

擬定產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)符合《辦法》和《體外診斷試劑注冊(cè)申報(bào)資料基本要求》(國(guó)食藥監(jiān)械〔2007〕609號(hào))的相關(guān)規(guī)定。另外,對(duì)于國(guó)產(chǎn)試劑,應(yīng)參考《中國(guó)生物制品規(guī)程》(2000年版),將申報(bào)產(chǎn)品的主要原材料、生產(chǎn)工藝及半成品檢定等內(nèi)容作為附錄附于標(biāo)準(zhǔn)正文后,并在正文的“產(chǎn)品分類”項(xiàng)中引出該附錄內(nèi)容。附錄中應(yīng)將待測(cè)靶基因的基因位點(diǎn)、引物/探針設(shè)計(jì)及來(lái)源、參考品設(shè)置、來(lái)源及驗(yàn)證情況、各種酶的來(lái)源、特性及驗(yàn)證等重點(diǎn)內(nèi)容予以明確。

腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑的注冊(cè)檢測(cè)應(yīng)主要包括以下性能指標(biāo):物理性狀、試劑盒內(nèi)陰/陽(yáng)性對(duì)照品(質(zhì)控品)的Ct值要求(包括內(nèi)標(biāo))、陰/陽(yáng)性參考品符合率、精密度、最低檢測(cè)限等。陽(yáng)性參考品主要考察對(duì)試劑盒覆蓋范圍內(nèi)不同突變基因的檢測(cè)符合性,陰性參考品則重點(diǎn)對(duì)申報(bào)試劑的分析特異性進(jìn)行驗(yàn)證。

如果申報(bào)試劑已有相應(yīng)的國(guó)家/行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)發(fā)布,則企業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的要求不得低于國(guó)家/行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的要求。

(四)注冊(cè)檢測(cè)

根據(jù)《辦法》的要求,首次申請(qǐng)注冊(cè)的第三類產(chǎn)品應(yīng)該在國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局認(rèn)可的、具有相應(yīng)承檢范圍的醫(yī)療器械檢測(cè)機(jī)構(gòu)進(jìn)行連續(xù)3個(gè)生產(chǎn)批次樣品的注冊(cè)檢測(cè)。對(duì)于已經(jīng)有國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)品的檢測(cè)項(xiàng)目,在注冊(cè)檢測(cè)時(shí)應(yīng)采用相應(yīng)的國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行,對(duì)于目前尚無(wú)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)品的項(xiàng)目,生產(chǎn)企業(yè)應(yīng)建立自己的參考品體系并提供相應(yīng)的內(nèi)部參考品。

(五)主要原材料研究資料

應(yīng)提供主要原材料如引物、探針、企業(yè)參考品的選擇與來(lái)源、制備過(guò)程、質(zhì)量分析和質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)等相關(guān)研究資料。若主要原材料為企業(yè)自己生產(chǎn),其生產(chǎn)工藝必須相對(duì)穩(wěn)定,并提交工藝驗(yàn)證報(bào)告;如主要原材料購(gòu)自其他供貨商,應(yīng)提供的資料包括:供貨方提供的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、出廠檢定報(bào)告,以及該原材料到貨后的質(zhì)量檢驗(yàn)資料。

1. 核酸分離/純化組分(如有)的主要組成、原理介紹及相關(guān)的驗(yàn)證資料。

2. PCR和/或逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)組分的主要原料(包括引物、探針、各種酶及其他主要原料)的選擇、制備、質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)及實(shí)驗(yàn)研究資料,主要包括以下內(nèi)容:

2.1脫氧三磷酸核苷(dNTP)

核酸的組成成分,包括:dATP、dUTP、dGTP、dCTP和dTTP;應(yīng)提交對(duì)純度、濃度、保存穩(wěn)定性等的驗(yàn)證資料。

2.2引物

由一定數(shù)量的dNTP構(gòu)成的特定序列,通常采用DNA合成儀人工合成,合成后經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)或其他適宜方法純化。需提供對(duì)分子量、純度、穩(wěn)定性、功能性實(shí)驗(yàn)等的驗(yàn)證資料。如為外購(gòu),還應(yīng)提供合成機(jī)構(gòu)出具的合成產(chǎn)物的質(zhì)檢證明,如PAGE結(jié)果或高效液相色譜法(HPLC)分析圖譜。

2.3探針

特定的帶有示蹤物(標(biāo)記物)的已知核酸片段(寡聚核苷酸片段),能與互補(bǔ)核酸序列退火雜交,用于特定核酸序列的探測(cè)。合成后經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)或其他適宜方法純化,在5-端(和/或3-端)進(jìn)行標(biāo)記,并經(jīng)HPLC或其他適宜方法純化,純度應(yīng)達(dá)到HPLC純。應(yīng)提供合成機(jī)構(gòu)出具的合成產(chǎn)物的質(zhì)檢證明,如HPLC分析圖譜,應(yīng)對(duì)探針的分子量、純度及標(biāo)記的熒光素進(jìn)行核實(shí),并進(jìn)行功能性試驗(yàn)驗(yàn)證。

2.4酶

DNA聚合酶,應(yīng)具有DNA聚合酶活性,無(wú)核酸內(nèi)切酶活性,具熱穩(wěn)定性,如:94℃保溫1小時(shí)后仍保持50%活性;尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG/UNG),具有水解尿嘧啶糖苷鍵的活性,無(wú)核酸外切酶及核酸內(nèi)切酶活性;逆轉(zhuǎn)錄酶,具逆轉(zhuǎn)錄酶活性,無(wú)核酸內(nèi)切酶活性。應(yīng)對(duì)酶活性進(jìn)行合理驗(yàn)證。

3. 核酸類檢測(cè)試劑的包裝材料和耗材應(yīng)無(wú)脫氧核糖核酸酶(DNase)和核糖核酸酶(RNase)污染。

4. 企業(yè)內(nèi)部參考品:應(yīng)詳細(xì)說(shuō)明有關(guān)企業(yè)內(nèi)部參考品的原料選擇、制備、定值過(guò)程等試驗(yàn)資料。具體要求如下:

4.1陽(yáng)性參考品

試劑盒(分型或不分型)所能覆蓋的所有突變位點(diǎn)均應(yīng)設(shè)置相應(yīng)的陽(yáng)性參考品,每個(gè)突變位點(diǎn)設(shè)置至少三個(gè)突變百分率梯度,其中需包括至少一份弱陽(yáng)性參考品。陽(yáng)性參考品的突變形式及濃度需經(jīng)過(guò)金標(biāo)準(zhǔn)方法或已上市同類分型試劑的確認(rèn)。

如申報(bào)試劑用于DNA樣本的檢測(cè),則陽(yáng)性參考品可以采用臨床樣本提取的DNA儲(chǔ)備液、相應(yīng)質(zhì)?;蚣?xì)胞系(如有)作為原料。如申報(bào)試劑用于RNA樣本的檢測(cè),陽(yáng)性參考品可以采用臨床樣本提取的RNA儲(chǔ)備液、相應(yīng)RNA凍干粉或模擬缺陷病毒(假病毒)的形式;如覆蓋突變位點(diǎn)過(guò)多,可以對(duì)其中部分突變位點(diǎn)采用質(zhì)粒的形式,但不能全部采用質(zhì)粒,需包括部分突變類型(申請(qǐng)人自行確定其代表性)RNA為模板的陽(yáng)性參考品以對(duì)逆轉(zhuǎn)錄(RT)過(guò)程進(jìn)行監(jiān)控。

4.2陰性參考品

可采用經(jīng)確認(rèn)無(wú)相應(yīng)靶突變序列的野生型DNA儲(chǔ)存液。

4.3檢測(cè)限參考品

檢測(cè)限參考品的原料要求參考陽(yáng)性參考品,需包括所有的突變類型。在進(jìn)行最低檢測(cè)限性能評(píng)估時(shí),應(yīng)設(shè)置多個(gè)梯度,主要從擴(kuò)增反應(yīng)終體系核酸濃度和突變序列所占百分率兩個(gè)方面進(jìn)行評(píng)價(jià),建議采用95%(n≥20)的陽(yáng)性檢出率作為最低檢測(cè)限確定的標(biāo)準(zhǔn)。當(dāng)設(shè)置檢測(cè)限參考品時(shí),可以僅設(shè)置一個(gè)濃度水平,該水平可略高于95%的陽(yáng)性檢出率水平,而設(shè)置為100%檢出,應(yīng)明確參考品中靶核酸濃度水平和突變百分率。

4.4精密度參考品

精密度參考品原料要求參考陽(yáng)性參考品,需至少包括弱陽(yáng)性、中或強(qiáng)陽(yáng)性水平的精密度驗(yàn)證,中/強(qiáng)陽(yáng)性精密度參考品可不必包括所有突變類型,以常見(jiàn)突變類型(申請(qǐng)人自行確定其代表性)為主,但弱陽(yáng)性參考品需包括所有突變位點(diǎn);如有必要,建議同時(shí)設(shè)置陰性參考品精密度驗(yàn)證。

5. 試劑盒內(nèi)對(duì)照品(質(zhì)控品)

試劑盒的質(zhì)控體系通過(guò)設(shè)置各種試劑盒對(duì)照品來(lái)實(shí)現(xiàn),質(zhì)控體系需考慮對(duì)樣本核酸分離/純化、配液及加樣、試劑及儀器性能、擴(kuò)增反應(yīng)抑制物(管內(nèi)抑制)、交叉污染、靶核酸降解等因素可能造成的假陰性或假陽(yáng)性結(jié)果進(jìn)行合理的質(zhì)量控制。所有陽(yáng)性對(duì)照品的核酸性質(zhì)應(yīng)與待測(cè)樣本的靶核酸性質(zhì)一致,如同為DNA或RNA。對(duì)照品可采用質(zhì)粒、假病毒或臨床樣本的核酸提取液等進(jìn)行配置。申報(bào)資料應(yīng)對(duì)試劑盒對(duì)照品有關(guān)原料選擇、制備、定值過(guò)程等試驗(yàn)資料詳細(xì)說(shuō)明。申請(qǐng)人應(yīng)視申報(bào)產(chǎn)品具體情況設(shè)置合理的試劑盒對(duì)照品(質(zhì)控品),試劑盒質(zhì)控體系主要考慮以下幾方面要求。

5.1陽(yáng)性對(duì)照品(質(zhì)控品)

建議對(duì)每個(gè)樣品反應(yīng)管設(shè)置至少一份陽(yáng)性對(duì)照品(質(zhì)控品),陽(yáng)性對(duì)照品應(yīng)參與樣本核酸的平行提?。ㄈ缬斜匾?,以對(duì)樣本核酸分離/純化、試劑及儀器性能、擴(kuò)增反應(yīng)過(guò)程等環(huán)節(jié)進(jìn)行質(zhì)量控制,企業(yè)應(yīng)對(duì)各種陽(yáng)性對(duì)照品(質(zhì)控品)的Ct值做出明確的范圍要求。如樣本反應(yīng)管內(nèi)可以覆蓋多種突變序列的檢測(cè)(分型或不分型),相應(yīng)的陽(yáng)性對(duì)照管可以不必涉及所有突變類型,但應(yīng)選擇較常見(jiàn)突變序列或理論上較難測(cè)得的突變序列作為陽(yáng)性對(duì)照。

5.2內(nèi)對(duì)照(內(nèi)標(biāo))

內(nèi)對(duì)照(內(nèi)標(biāo))可以對(duì)管內(nèi)抑制導(dǎo)致的假陰性結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制,尤其是靶核酸為RNA、用于基因重排或基因表達(dá)異常等檢測(cè)目的時(shí),可以采用管家基因或與靶基因濃度水平相當(dāng)?shù)钠渌蛐蛄凶鳛橄鄳?yīng)的內(nèi)對(duì)照(內(nèi)標(biāo))。申請(qǐng)人應(yīng)對(duì)內(nèi)對(duì)照(內(nèi)標(biāo))的引物、探針和模板濃度做精確驗(yàn)證,既要保證內(nèi)標(biāo)熒光通道呈明顯的陽(yáng)性曲線又要盡量降低對(duì)靶基因檢測(cè)造成的抑制而導(dǎo)致假陰性。

5.3陰性對(duì)照

陰性對(duì)照可以是含有野生型核酸序列的核酸溶液,也可以是空白對(duì)照,以對(duì)可能存在的交叉污染進(jìn)行假陽(yáng)性結(jié)果的質(zhì)控。陰性對(duì)照品應(yīng)參與樣本核酸的平行提取。

由于臨床標(biāo)本多為經(jīng)過(guò)復(fù)雜處理的病理切片或組織,其中核酸的完整性容易被破壞,從而影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,造成假陰性的可能性。因此,除上述對(duì)照品外,申報(bào)試劑的反應(yīng)體系中應(yīng)充分考慮對(duì)核酸分離/純化環(huán)節(jié)的質(zhì)量控制,比如,設(shè)置專門的質(zhì)控管對(duì)管家基因或其他源于人類基因組DNA的靶序列進(jìn)行擴(kuò)增,以對(duì)核酸分離/純化的質(zhì)量及效率進(jìn)行評(píng)估。

(六)主要生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系的研究資料

生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系的研究資料應(yīng)能對(duì)反應(yīng)體系涉及到的基本內(nèi)容,如臨床樣本用量、試劑用量、反應(yīng)條件、質(zhì)控體系設(shè)置、Ct(臨界)值確定等,提供確切的依據(jù),配制工作液的各種原材料及其配比應(yīng)符合要求,原材料應(yīng)混合均勻,配制過(guò)程應(yīng)對(duì)pH、電導(dǎo)率、離子濃度等關(guān)鍵參數(shù)進(jìn)行有效控制。主要包括以下內(nèi)容:

1. 主要生產(chǎn)工藝介紹,可以圖表方式表示。

2. 反應(yīng)原理介紹。

3. 基因位點(diǎn)選擇、(RT)-PCR方法學(xué)特性介紹。

4. 確定最佳(RT)-PCR反應(yīng)體系的研究資料,包括酶濃度、引物/探針濃度、dNTP濃度、陽(yáng)離子濃度等。

5. 確定逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程(如涉及)的溫度和時(shí)間的研究資料,PCR反應(yīng)各階段溫度、時(shí)間及循環(huán)數(shù)的研究資料。

6. 對(duì)于基線閾值(threshold)和閾值循環(huán)數(shù)(Ct)確定的研究資料。

7. 不同適用機(jī)型的反應(yīng)條件如果有差異應(yīng)分別詳述。

8. 如申報(bào)產(chǎn)品包含核酸分離/純化試劑,應(yīng)提交對(duì)核酸分離/純化過(guò)程進(jìn)行工藝優(yōu)化的研究資料。

(七)分析性能評(píng)估資料

企業(yè)應(yīng)提交在產(chǎn)品研制階段對(duì)試劑盒進(jìn)行的所有性能驗(yàn)證的研究資料,包括具體研究方法、內(nèi)控標(biāo)準(zhǔn)、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、統(tǒng)計(jì)分析等詳細(xì)資料。若試劑用于RNA樣本檢測(cè),則在性能評(píng)估中(除非特別說(shuō)明)需對(duì)所有突變位點(diǎn)均采用RNA樣本,從而對(duì)逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程進(jìn)行驗(yàn)證。

建議著重對(duì)以下分析性能進(jìn)行研究。

1. 樣本核酸分離/純化

樣本核酸的分離/純化主要有以下目的:富集靶核酸濃度、保證靶核酸序列的完整性、增加PCR模板溶液均一性、去除PCR抑制物,樣本核酸分離/純化是決定后續(xù)核酸擴(kuò)增過(guò)程成敗的要素之一。尤其是石蠟包埋組織樣本在福爾馬林固定過(guò)程中,會(huì)使樣品中的核酸與核酸之間,核酸與蛋白之間發(fā)生交聯(lián),并且樣本在不當(dāng)?shù)谋4鏃l件下容易造成核酸的片段化或降解,增加了核酸分離/純化的難度。因此,無(wú)論申報(bào)產(chǎn)品是否含有核酸分離/純化的組分,企業(yè)都應(yīng)對(duì)核酸分離/純化的環(huán)節(jié)做充分的驗(yàn)證。除最大量分離出目的核酸外,還應(yīng)有相應(yīng)的純化步驟,盡可能去除PCR抑制物。常見(jiàn)的核酸分離純化均有其優(yōu)勢(shì)和不足,申請(qǐng)人應(yīng)結(jié)合申報(bào)產(chǎn)品的特性,合理選擇核酸分離/純化試劑,并提供詳細(xì)的驗(yàn)證資料。

2. 陽(yáng)性/陰性參考品符合率

各水平、各突變位點(diǎn)的陽(yáng)性參考品均應(yīng)按要求檢出陽(yáng)性,考慮到濃度梯度的不同,應(yīng)對(duì)各水平陽(yáng)性參考品設(shè)置相應(yīng)Ct值的限制;陰性參考品在各個(gè)引物探針組合的檢測(cè)條件下均應(yīng)檢出為陰性;如有野生型參考品的設(shè)置,在其相應(yīng)的引物探針組合下檢測(cè)應(yīng)為陽(yáng)性。

3. 最低檢測(cè)限

建議采用95%(n≥20)的陽(yáng)性檢出率作為最低檢測(cè)限確定的標(biāo)準(zhǔn),擴(kuò)增反應(yīng)終體系中的突變序列百分率和總核酸濃度兩個(gè)因素對(duì)最低檢測(cè)限的影響較大,終體系中突變序列的百分率越高、所含的DNA(RNA)量越多,則越容易檢出。因此,試劑盒最低檢測(cè)限主要考慮以下兩種情形。

3.1在擴(kuò)增反應(yīng)終體系特定核酸濃度下,突變序列所占百分率的最低檢測(cè)限。

采用野生型臨床樣本和較高突變百分率的臨床樣本提取的核酸儲(chǔ)備液進(jìn)行混合,確定擴(kuò)增反應(yīng)終體系中的核酸濃度,采用合理的試驗(yàn)方法(如深測(cè)序)對(duì)混合后樣本中突變序列所占百分率進(jìn)行確認(rèn),并逐漸調(diào)整野生型和突變型核酸儲(chǔ)備液的比例以得到含不同突變序列百分率的混合液。如上述方法不易實(shí)現(xiàn),也可采用含相應(yīng)突變類型的質(zhì)粒與野生型基因組DNA(或野生型質(zhì)粒)混合的方法來(lái)制備相應(yīng)的混合液。對(duì)各份混合液進(jìn)行不少于20次的重復(fù)檢測(cè),確定95%陽(yáng)性檢出率水平,作為在固定的核酸濃度條件下,可以檢測(cè)到的最低的突變序列百分率。

舉例:在50ng/40μL水平,可以達(dá)到95%陽(yáng)性檢出率的最低突變序列百分率為10%。

3.2在特定突變序列百分率下,反應(yīng)終體系中核酸濃度的最低檢測(cè)限。

采用合理的實(shí)驗(yàn)方法確定待測(cè)樣本中的突變序列所占的百分率,或采用突變型質(zhì)粒與野生型基因組DNA(或野生型質(zhì)粒)按一定比例混合(如固定在10%的水平),再逐級(jí)稀釋成不同核酸濃度樣本,分別對(duì)各梯度濃度樣本進(jìn)行不少于20次的重復(fù)檢測(cè),確定95%陽(yáng)性檢出率的最低DNA(RNA)濃度。

舉例:在10%的突變序列百分率水平,40μL擴(kuò)增反應(yīng)終體系中,DNA濃度的最低檢測(cè)限為50ng/40μL。

3.3建議評(píng)價(jià)腫瘤細(xì)胞比例、DNA(RNA)降解等因素對(duì)最低檢測(cè)限可能造成的影響。

4. 分析特異性

4.1野生型驗(yàn)證:采用不同濃度的野生型核酸樣本進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果應(yīng)為陰性。

4.2交叉反應(yīng),對(duì)于此類產(chǎn)品的交叉反應(yīng)驗(yàn)證主要考慮以下幾方面情形:

4.2.1申報(bào)試劑所覆蓋的全部突變類型間的交叉反應(yīng);

4.2.2核酸序列相近或具有同源性、易引起交叉反應(yīng)的野生型或其他突變類型序列間的交叉反應(yīng)。

申請(qǐng)人應(yīng)提供所有用于交叉反應(yīng)驗(yàn)證的突變或野生型序列來(lái)源、序列確認(rèn)和濃度選擇等試驗(yàn)資料。有關(guān)交叉反應(yīng)驗(yàn)證的信息應(yīng)在產(chǎn)品說(shuō)明書的【產(chǎn)品性能指標(biāo)】項(xiàng)中有所體現(xiàn)。

4.3干擾物質(zhì)

4.3.1申請(qǐng)人應(yīng)根據(jù)試劑盒所采用的樣本類型,確定潛在的干擾物質(zhì)。

4.3.2用于干擾試驗(yàn)的樣本,靶基因濃度應(yīng)至少包含弱陽(yáng)性,而不應(yīng)僅選擇強(qiáng)陽(yáng)性樣本,使用醫(yī)學(xué)相關(guān)水平的干擾物質(zhì)進(jìn)行驗(yàn)證。此外,建議申請(qǐng)人同時(shí)在每種干擾物質(zhì)的潛在最大濃度(“最差條件”)條件下同樣進(jìn)行評(píng)價(jià)。

有關(guān)干擾物質(zhì)的研究結(jié)果亦應(yīng)總結(jié)于產(chǎn)品說(shuō)明書的【產(chǎn)品性能指標(biāo)】項(xiàng)下。

5. 精密度

測(cè)量精密度的評(píng)價(jià)方法并無(wú)統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)可依,可根據(jù)不同產(chǎn)品特征或企業(yè)的研究習(xí)慣進(jìn)行,前提是必須保證研究的科學(xué)合理性。具體實(shí)驗(yàn)方法可以參考國(guó)際或國(guó)內(nèi)有關(guān)體外診斷產(chǎn)品性能評(píng)估的文件進(jìn)行。企業(yè)應(yīng)對(duì)每項(xiàng)精密度指標(biāo)的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)做出合理要求,如標(biāo)準(zhǔn)差或變異系數(shù)的范圍等。針對(duì)本類產(chǎn)品的精密度評(píng)價(jià)主要包括以下要求。

5.1對(duì)可能影響檢測(cè)精密度的主要變量進(jìn)行驗(yàn)證,除申報(bào)試劑(包括核酸分離/純化組分)本身的影響外,還應(yīng)對(duì)PCR分析儀、操作者、地點(diǎn)等要素進(jìn)行相關(guān)的驗(yàn)證。

5.2合理的精密度評(píng)價(jià)周期,例如:為期至少20天的連續(xù)檢測(cè),每天至少由2人完成不少于2次的完整檢測(cè),從而對(duì)批內(nèi)/批間、日內(nèi)/日間以及不同操作者之間的精密度進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)。如有條件,申請(qǐng)人應(yīng)選擇不同的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)以對(duì)室間精密度進(jìn)行評(píng)價(jià)。

5.3用于精密度評(píng)價(jià)的參考品應(yīng)至少包括弱陽(yáng)性參考品和高濃度參考品2個(gè)水平,如有必要,建議同時(shí)設(shè)置陰性參考品進(jìn)行驗(yàn)證,要求如下:

5.3.1陰性參考品:待測(cè)靶核酸濃度低于最低檢測(cè)限或?yàn)榱銤舛龋ㄗh選用背景值較高的陰性樣本,陰性符合率應(yīng)為100%(n≥20)。

5.3.2弱陽(yáng)性參考品:待測(cè)靶核酸濃度略高于試劑盒的最低檢測(cè)限,陽(yáng)性檢出率應(yīng)達(dá)到100%(n≥20)。(弱陽(yáng)性參考品需包括所有的突變位點(diǎn),如果待測(cè)物靶核酸為RNA,則弱陽(yáng)性精密度參考品中應(yīng)至少部分典型突變位點(diǎn)的原料為RNA,如RNA干粉或相應(yīng)的假病毒)

5.3.3高濃度參考品:待測(cè)靶核酸呈中到強(qiáng)陽(yáng)性的濃度,陽(yáng)性檢出率為100%且CV≤15%(n≥20)。(如果試劑盒可以覆蓋多個(gè)突變位點(diǎn)的檢測(cè),該參考品可以設(shè)置為對(duì)全部突變位點(diǎn)進(jìn)行精密度驗(yàn)證,也可以選擇其中部分突變位點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證,但應(yīng)至少包含常見(jiàn)突變序列或理論上較難測(cè)得的突變序列)

6. 其他需注意問(wèn)題

對(duì)于適用多個(gè)機(jī)型的產(chǎn)品,應(yīng)提供如產(chǎn)品說(shuō)明書【適用儀器】項(xiàng)中所列的所有型號(hào)儀器的性能評(píng)估資料。若試劑盒適用的樣本類型不止一種,如既包含石蠟包埋組織切片亦包含冷凍組織切片或血液樣本等,則需對(duì)所有樣本類型的適用性進(jìn)行評(píng)估,并提交評(píng)估資料。

(八)參考值(參考范圍)確定資料

對(duì)于此類試劑,參考值確定資料主要是指Ct值的確認(rèn)資料,建議申請(qǐng)人采用受試者工作特征(ROC)曲線的方式對(duì)申報(bào)產(chǎn)品用于結(jié)果判斷的臨界值予以確認(rèn)。

(九)穩(wěn)定性研究資料

穩(wěn)定性研究資料主要涉及兩部分內(nèi)容,申報(bào)試劑的穩(wěn)定性和適用樣本的穩(wěn)定性研究。前者主要包括效期穩(wěn)定性(有效期)、開(kāi)瓶穩(wěn)定性、復(fù)溶穩(wěn)定性、運(yùn)輸穩(wěn)定性及凍融次數(shù)限制等研究,申請(qǐng)人可根據(jù)實(shí)際需要選擇合理的穩(wěn)定性研究方案。穩(wěn)定性研究資料應(yīng)包括研究方法的確定依據(jù)、具體的實(shí)施方案、詳細(xì)的研究數(shù)據(jù)以及結(jié)論。對(duì)于效期穩(wěn)定性研究,應(yīng)提供至少三批樣品在實(shí)際儲(chǔ)存條件下保存至成品有效期后的研究資料。

另外,樣本穩(wěn)定性的研究對(duì)于實(shí)驗(yàn)的成敗也至關(guān)重要。特別是當(dāng)使用標(biāo)本類型包括組織標(biāo)本時(shí),腫瘤組織標(biāo)本經(jīng)過(guò)特殊處理后其核酸序列的完整性容易遭到破壞,因此應(yīng)提供對(duì)樣本保存條件、保存時(shí)間等方面的詳細(xì)研究資料。樣本穩(wěn)定性研究主要包括核酸分離/純化前樣本穩(wěn)定性和分離/純化后核酸在儲(chǔ)備液中的穩(wěn)定性兩方面。在合理的溫度范圍內(nèi)選擇多個(gè)溫度點(diǎn)(應(yīng)至少包括范圍的上限和下限溫度),每間隔一定的時(shí)間段即對(duì)儲(chǔ)存樣本進(jìn)行分析驗(yàn)證,從而確認(rèn)不同類型樣本的穩(wěn)定性。適于冷凍保存的樣本還應(yīng)對(duì)凍融次數(shù)進(jìn)行評(píng)價(jià)。

試劑穩(wěn)定性和樣本穩(wěn)定性兩部分內(nèi)容的研究結(jié)果均應(yīng)在說(shuō)明書【儲(chǔ)存條件及有效期】和【樣本要求】?jī)身?xiàng)中進(jìn)行詳細(xì)說(shuō)明。

(十)臨床試驗(yàn)研究

對(duì)于國(guó)內(nèi)外尚無(wú)同類產(chǎn)品被批準(zhǔn)上市或無(wú)充足資料證明其臨床預(yù)期用途的新型腫瘤相關(guān)基因突變,相關(guān)檢測(cè)試劑的臨床研究不能單純采用對(duì)比試驗(yàn)的方法,而應(yīng)將試劑盒臨床研究納入相關(guān)藥物的臨床研究或臨床應(yīng)用中,通過(guò)對(duì)特定的腫瘤病人進(jìn)行治療前后的跟蹤隨訪,以臨床對(duì)于患者個(gè)體化治療方案及有效性的綜合判斷為金標(biāo)準(zhǔn),評(píng)價(jià)此類試劑用于指導(dǎo)腫瘤個(gè)體化治療的臨床性能。其中,有關(guān)診斷試劑臨床研究的臨床試驗(yàn)資料應(yīng)符合《辦法》、《體外診斷試劑注冊(cè)申報(bào)資料基本要求》(國(guó)食藥監(jiān)械〔2007〕609號(hào))以及《體外診斷試劑臨床研究技術(shù)指導(dǎo)原則》的要求。

對(duì)于已有同類產(chǎn)品上市的、基因突變類型與腫瘤個(gè)體化治療方案的相關(guān)性已經(jīng)得到確認(rèn)的產(chǎn)品,則申請(qǐng)人既可采用試劑盒檢測(cè)與相關(guān)藥物治療相結(jié)合對(duì)特定的腫瘤病人進(jìn)行治療前后的跟蹤臨床研究的方法,亦可在充分結(jié)合相關(guān)的病例信息的情況下,采用考核試劑與參比方法進(jìn)行對(duì)比試驗(yàn)的研究方法,對(duì)考核試劑的臨床應(yīng)用有效性進(jìn)行評(píng)價(jià)。

以下要求均針對(duì)采用對(duì)比試驗(yàn)方法的臨床研究提出。

1. 參比方法的選擇可以考慮以下幾方面:

1.1如已有同類產(chǎn)品上市,其臨床研究可以選擇境內(nèi)已批準(zhǔn)上市、臨床普遍認(rèn)為質(zhì)量較好的同類產(chǎn)品作為參比試劑,采用擬申報(bào)產(chǎn)品(以下稱考核試劑)與之進(jìn)行對(duì)比試驗(yàn)研究,證明本品與已上市產(chǎn)品等效或優(yōu)于已上市產(chǎn)品。但應(yīng)充分考慮已上市同類試劑的突變位點(diǎn)選擇、靶序列選擇、最低檢測(cè)限等特性,確??己嗽噭┡c申報(bào)試劑具有明確可比性。

1.2申請(qǐng)人亦可采用核酸序列測(cè)定方法作為此類試劑臨床試驗(yàn)研究的參比方法,驗(yàn)證考核試劑檢測(cè)結(jié)果與核酸序列測(cè)定(測(cè)序)結(jié)果之間的一致性情況。臨床研究報(bào)告中應(yīng)對(duì)選用的測(cè)序方法作詳細(xì)介紹,并對(duì)委托測(cè)序服務(wù)的機(jī)構(gòu)(如涉及)資質(zhì)和選擇依據(jù)作簡(jiǎn)要說(shuō)明或提供相關(guān)資料。

申請(qǐng)人應(yīng)提供以下關(guān)于測(cè)序部分的詳細(xì)試驗(yàn)資料,需有臨床試驗(yàn)單位或委托測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)的簽章確認(rèn)。

1.2.1測(cè)序方法原理、測(cè)序儀型號(hào)、測(cè)序試劑及消耗品的相關(guān)信息。

1.2.2測(cè)序方法所用引物相關(guān)信息,如基因區(qū)段選擇,分子量、純度、功能性實(shí)驗(yàn)等資料。引物設(shè)計(jì)應(yīng)合理涵蓋考核試劑擴(kuò)增的靶核酸區(qū)段、位點(diǎn)、及所有突變類型。

1.2.3對(duì)所選測(cè)序方法的分析性能進(jìn)行合理驗(yàn)證,尤其是最低檢測(cè)限的確認(rèn),建議將所選測(cè)序方法與申報(bào)試劑的相關(guān)性能進(jìn)行適當(dāng)比對(duì)分析。

1.2.4測(cè)序方法應(yīng)建立合理的陽(yáng)性質(zhì)控品和陰性質(zhì)控品對(duì)臨床樣本的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制。

1.2.5提交有代表性的樣本測(cè)序圖譜及結(jié)果分析資料。

1.3此外,在充分考慮檢測(cè)結(jié)果具有明確可比性的前提下,也可以選擇熒光原位雜交(FISH)或免疫組化等染色體或蛋白水平的檢測(cè)技術(shù)作為參比方法,但考慮到檢測(cè)結(jié)果之間不具有直接的可比性,建議對(duì)所有陽(yáng)性病例采用其他分子生物學(xué)技術(shù)(如核酸序列測(cè)定)對(duì)結(jié)果予以確認(rèn)。測(cè)序部分資料的提交參考上一條要求。

2. 臨床研究單位的選擇

建議申請(qǐng)人在選擇臨床單位時(shí),應(yīng)在國(guó)內(nèi)不同區(qū)域選擇臨床單位,盡量使各單位的臨床樣本有一定的區(qū)域代表性;臨床研究單位應(yīng)具有分子病理診斷和分子生物學(xué)方法檢測(cè)的優(yōu)勢(shì),實(shí)驗(yàn)操作人員應(yīng)有足夠的時(shí)間熟悉檢測(cè)系統(tǒng)的各環(huán)節(jié)(儀器、試劑、質(zhì)控及操作程序等),熟悉評(píng)價(jià)方案。在整個(gè)實(shí)驗(yàn)中,考核試劑和參比方法都應(yīng)處于有效的質(zhì)量控制下,最大限度保證試驗(yàn)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性及可重復(fù)性。

3. 臨床試驗(yàn)方案

臨床試驗(yàn)實(shí)施前,研究人員應(yīng)從流行病學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)等多方面考慮,設(shè)計(jì)科學(xué)合理的臨床研究方案。各臨床研究機(jī)構(gòu)的方案設(shè)置應(yīng)基本一致,且保證在整個(gè)臨床試驗(yàn)過(guò)程中遵循預(yù)定的方案實(shí)施,不可隨意改動(dòng)。整個(gè)試驗(yàn)過(guò)程應(yīng)在臨床研究機(jī)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)室內(nèi)并由本實(shí)驗(yàn)室的技術(shù)人員操作完成,申報(bào)單位的技術(shù)人員除進(jìn)行必要的技術(shù)指導(dǎo)外,不得隨意干涉實(shí)驗(yàn)進(jìn)程,尤其是數(shù)據(jù)收集過(guò)程。

試驗(yàn)方案中應(yīng)確定嚴(yán)格的病例納入/排除標(biāo)準(zhǔn),任何已經(jīng)入選的病例再被排除出臨床研究都應(yīng)記錄在案并明確說(shuō)明原因。在試驗(yàn)操作過(guò)程中和判定試驗(yàn)結(jié)果時(shí)應(yīng)采用盲法以保證試驗(yàn)結(jié)果的客觀性。各研究單位選用的參比試劑應(yīng)完全一致,以便進(jìn)行合理的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。臨床方案中還應(yīng)明確復(fù)核試劑及方法。另外,考核試劑適用的樣本類型、可檢測(cè)的基因突變類型不應(yīng)超越參比試劑的相應(yīng)檢測(cè)要求,若此種情況發(fā)生,則應(yīng)選擇其他合理參比方法對(duì)額外的樣本類型和基因突變類型進(jìn)行驗(yàn)證。

4. 病例選擇及陽(yáng)性病例比例

臨床試驗(yàn)應(yīng)以腫瘤患者為研究對(duì)象,其中試劑盒規(guī)定范圍的每種突變類型均應(yīng)有一定量的陽(yáng)性病例。對(duì)于陰性病例的選擇,也應(yīng)考慮到交叉反應(yīng)驗(yàn)證的需要,以從臨床角度考察其分析特異性。陰/陽(yáng)性病例均應(yīng)覆蓋所有適用的腫瘤類型。若產(chǎn)品適用于多種樣本類型,則應(yīng)對(duì)所有樣本類型均進(jìn)行臨床驗(yàn)證。

5. 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

對(duì)臨床試驗(yàn)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)應(yīng)選擇合適的統(tǒng)計(jì)方法,如檢測(cè)結(jié)果一致性分析、受試者工作特征(ROC)曲線分析、陰性/陽(yáng)性符合率等。對(duì)于本類產(chǎn)品對(duì)比實(shí)驗(yàn)的等效性研究,常選擇交叉四格表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測(cè)結(jié)果,對(duì)定性結(jié)果進(jìn)行四格表χ2檢驗(yàn)或kappa檢驗(yàn)以驗(yàn)證兩種試劑定性結(jié)果的一致性,統(tǒng)計(jì)分析應(yīng)可以證明兩種方法的檢測(cè)結(jié)果有無(wú)明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。在臨床研究方案中應(yīng)明確統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)假設(shè),即評(píng)價(jià)考核試劑與參比試劑是否等效的標(biāo)準(zhǔn)。

6. 結(jié)果差異樣本的驗(yàn)證

在數(shù)據(jù)收集過(guò)程中,對(duì)于兩種方法檢測(cè)結(jié)果不一致的樣本,應(yīng)采用“金標(biāo)準(zhǔn)”方法或臨床上普遍認(rèn)為質(zhì)量較好的第三種同類試劑進(jìn)行復(fù)核,同時(shí)結(jié)合患者的臨床病情對(duì)差異原因及可能結(jié)果進(jìn)行分析。

7. 臨床試驗(yàn)總結(jié)報(bào)告撰寫

根據(jù)《體外診斷試劑臨床研究技術(shù)指導(dǎo)原則》的要求,臨床試驗(yàn)報(bào)告應(yīng)該對(duì)試驗(yàn)的整體設(shè)計(jì)及各個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)給予清晰、完整的闡述,應(yīng)該對(duì)整個(gè)臨床試驗(yàn)實(shí)施過(guò)程、結(jié)果分析、結(jié)論等進(jìn)行條理分明的描述,并應(yīng)包括必要的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和統(tǒng)計(jì)分析方法。建議在臨床總結(jié)報(bào)告中對(duì)以下內(nèi)容進(jìn)行詳述。

7.1臨床試驗(yàn)總體設(shè)計(jì)及方案描述

7.1.1臨床試驗(yàn)的整體管理情況、臨床研究單位選擇、臨床主要研究人員簡(jiǎn)介等基本情況介紹。

7.1.2病例納入/排除標(biāo)準(zhǔn)、不同年齡段人群的預(yù)期選擇例數(shù)及標(biāo)準(zhǔn)。

7.1.3樣本類型,樣本的收集、處理及保存等。

7.1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)方法、統(tǒng)計(jì)軟件、評(píng)價(jià)統(tǒng)計(jì)結(jié)果的標(biāo)準(zhǔn)。

7.2具體的臨床試驗(yàn)情況

7.2.1臨床研究所用產(chǎn)品的名稱、批號(hào)、有效期及所用機(jī)型等信息,以及對(duì)比試驗(yàn)產(chǎn)品的注冊(cè)情況。

7.2.2對(duì)各研究單位的病例數(shù)、年齡分布情況進(jìn)行綜合分析,建議以列表或圖示方式給出具體例數(shù)及百分比。

7.2.3質(zhì)量控制,試驗(yàn)人員培訓(xùn)、儀器日常維護(hù)、質(zhì)控品運(yùn)行情況,對(duì)檢測(cè)精密度、質(zhì)控品測(cè)量值的抽查結(jié)果評(píng)估。

7.2.4具體試驗(yàn)過(guò)程,樣本檢測(cè)、數(shù)據(jù)收集、樣本保存、結(jié)果不一致樣本的校驗(yàn)等。

7.3統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

7.3.1數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測(cè)或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對(duì)異常值或缺失值的處理、研究過(guò)程中是否涉及對(duì)方案的修改。

7.3.2陽(yáng)性符合率、陰性符合率、總體符合率。

7.3.3以交叉四格表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測(cè)結(jié)果,對(duì)定性結(jié)果進(jìn)行四格表χ2檢驗(yàn)或kappa檢驗(yàn)以驗(yàn)證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。

另外考慮到對(duì)不同樣本類型以及不同年齡段人群的檢測(cè)結(jié)果可能存在一定差異,故建議對(duì)不同樣本類型及不同年齡段人群分別進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以對(duì)考核試劑的臨床性能進(jìn)行綜合分析。

7.4討論和結(jié)論

對(duì)總體結(jié)果進(jìn)行總結(jié)性描述并簡(jiǎn)要分析試驗(yàn)結(jié)果,對(duì)本次臨床研究有無(wú)特別說(shuō)明,最后得出臨床試驗(yàn)結(jié)論。

三、名詞解釋

1. 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) polymerase chain reaction, PCR:

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)或多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是一種對(duì)特定的DNA或RNA片段在體外進(jìn)行快速擴(kuò)增的方法。由變性-退火-延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成。

2. 雜交 hybridization

具有一定同源序列的兩條核酸單鏈(DNA或RNA)可以通過(guò)氫鍵的方式,按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則相結(jié)合。

3. 熒光探針PCR

在PCR過(guò)程中利用熒光標(biāo)記的特異性探針,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,釋放的熒光能量的變化直接反映出PCR擴(kuò)增產(chǎn)物量的變化,并通過(guò)對(duì)熒光的采集和分析以達(dá)到對(duì)原始模板量進(jìn)行分析的PCR。

4. 分析特異性 analytical specificity

測(cè)量程序只測(cè)量被測(cè)量物的能力。分析特異性用于描述檢測(cè)程序在樣本中有其他物質(zhì)存在時(shí)只測(cè)量被測(cè)量物的能力。通常以一個(gè)被評(píng)估的潛在干擾物清單來(lái)描述,并給出在特定醫(yī)學(xué)相關(guān)濃度值水平的分析干擾程度。(潛在干擾物包括干擾物和交叉反應(yīng)物)

5. 精密度 precision

在規(guī)定條件下,相互獨(dú)立的測(cè)試結(jié)果之間的一致程度。精密度的程度是用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法得到的測(cè)量不精密度的數(shù)字形式表示,如標(biāo)準(zhǔn)差(SD)和變異系數(shù)(CV)。

6. 檢測(cè)限 detection limit, limit of detection

樣品中以一定概率可被聲明與零有差異的被測(cè)測(cè)量的最低值。

7. 閾值循環(huán)數(shù) cycle threshold, Ct

實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增過(guò)程中,反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)到達(dá)指數(shù)擴(kuò)增時(shí)經(jīng)歷的循環(huán)周期數(shù)。主要的計(jì)算方式是以擴(kuò)增過(guò)程前3到15個(gè)循環(huán)的熒光值的10倍標(biāo)準(zhǔn)差為閾值,當(dāng)熒光值超過(guò)閾值時(shí)的循環(huán)數(shù)則為閾值循環(huán)數(shù)(Ct)。

8. 突變 mutation

是細(xì)胞中DNA核苷酸序列發(fā)生了穩(wěn)定的可遺傳的改變。

9. 內(nèi)標(biāo) internal control

在同一反應(yīng)管中與靶序列共同擴(kuò)增的一段非靶序列分子,其目的是鑒別儀器故障、試劑因素、聚合酶活性因素或樣本中存在抑制物等造成的結(jié)果不理想的原因。

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腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑
技術(shù)審查指導(dǎo)原則編制說(shuō)明

一、背景信息

近年來(lái),腫瘤的治療取得了相當(dāng)大的進(jìn)展,然而,在腫瘤的治療中,無(wú)論是療效還是毒性反應(yīng)都存在較大的個(gè)體差異。即使是同一個(gè)部位的腫瘤,相同的治療方法對(duì)不同的個(gè)體也會(huì)導(dǎo)致不同的治療結(jié)果。如用于治療非小細(xì)胞型肺癌的藥物吉非替尼,絕大多數(shù)的非小細(xì)胞肺癌病人對(duì)吉非替尼無(wú)反應(yīng),但約10%的病人對(duì)吉非替尼表現(xiàn)出快速且非常顯著的療效。研究發(fā)現(xiàn),EGFR基因18-21號(hào)外顯子序列發(fā)生突變后會(huì)使吉非替尼的療效更好。在臨床上通過(guò)檢測(cè)腫瘤患者,腫瘤組織中基因突變靶點(diǎn)及基因單核苷酸序列多態(tài)性(SNP)分型、基因重排、基因拷貝數(shù)異常、核糖體核糖核酸(mRNA)表達(dá)異常等為臨床提供個(gè)體化治療的依據(jù),能顯著提高治療的效率,降低藥物的毒副作用。目前用于腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變的檢測(cè)還有:CYP2C19基因檢測(cè)、HER-2基因檢測(cè)、K-ras基因檢測(cè)等。進(jìn)行腫瘤個(gè)體化治療的基礎(chǔ)和前提是腫瘤分子靶標(biāo)檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。多種原因會(huì)影響檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,包括檢測(cè)試劑的方法學(xué)上的局限性,檢測(cè)試劑原材料的設(shè)計(jì)和選擇等,除此之外,樣本質(zhì)量對(duì)檢測(cè)結(jié)果也有影響,如:樣本中核酸的分離/純化過(guò)程、樣本中不可避免的一些干擾物質(zhì)等。假陽(yáng)性的檢測(cè)結(jié)果不僅使患者的治療達(dá)不到預(yù)期的效果,還會(huì)使病人承受不必要的痛苦;而假陰性的檢測(cè)結(jié)果會(huì)給臨床醫(yī)生錯(cuò)誤的用藥指導(dǎo),使病人錯(cuò)過(guò)最佳的治療時(shí)機(jī),最終導(dǎo)致病人病情的惡化,甚至死亡。因此相關(guān)的生產(chǎn)企業(yè)必須充分意識(shí)到該類產(chǎn)品的潛在風(fēng)險(xiǎn),根據(jù)本指導(dǎo)原則的要求對(duì)該類試劑的安全性和有效性進(jìn)行科學(xué)合理的驗(yàn)證。

腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑是指利用基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)方法的核酸檢測(cè)技術(shù),以腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)的突變基因?yàn)闄z測(cè)目標(biāo),對(duì)人體樣本(包括組織、體液等)提取的核酸組份中的目標(biāo)序列進(jìn)行體外檢測(cè)的試劑。

二、編制目的

目前,涉及腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)試劑研制及注冊(cè)申報(bào)的生產(chǎn)企業(yè)眾多,但不同廠家的產(chǎn)品在擴(kuò)增引物、熒光探針的設(shè)計(jì)及臨床驗(yàn)證等方面差異較大,分析性能明顯不一,雖然《體外診斷試劑注冊(cè)管理辦法(試行)》(以下簡(jiǎn)稱《辦法》)、《體外診斷試劑說(shuō)明書編寫指導(dǎo)原則》、《體外診斷試劑臨床研究指導(dǎo)原則》等體外診斷試劑法規(guī)文件對(duì)該類試劑的注冊(cè)申報(bào)資料提出了原則性要求,但在技術(shù)審評(píng)環(huán)節(jié)中仍然遇到許多細(xì)節(jié)性技術(shù)問(wèn)題有待統(tǒng)一。隨著技術(shù)審評(píng)工作的不斷積累,對(duì)該類產(chǎn)品的技術(shù)要求以及存在問(wèn)題也逐漸明確,因此,有必要制定相關(guān)的技術(shù)指導(dǎo)原則對(duì)這些共性問(wèn)題進(jìn)行總結(jié)規(guī)范。

本指導(dǎo)原則旨在讓申請(qǐng)人明確審評(píng)部門對(duì)本類試劑重點(diǎn)關(guān)注的內(nèi)容、規(guī)范注冊(cè)申請(qǐng)人對(duì)注冊(cè)申報(bào)資料的準(zhǔn)備及撰寫、解釋企業(yè)在注冊(cè)申報(bào)過(guò)程中對(duì)一些常見(jiàn)問(wèn)題的疑惑、盡量減少技術(shù)審評(píng)環(huán)節(jié)的注冊(cè)資料補(bǔ)充,同時(shí)有利于規(guī)范技術(shù)審評(píng)要求,統(tǒng)一審評(píng)尺度。本文內(nèi)容不包括注冊(cè)審批的行政事項(xiàng),亦不作為法規(guī)強(qiáng)制執(zhí)行。企業(yè)在實(shí)際操作過(guò)程中可以采用其他合理方式,但應(yīng)有充分的證據(jù)說(shuō)明其所用方法可以有力保證試劑的安全有效性。

三、重點(diǎn)技術(shù)問(wèn)題的說(shuō)明

(一)產(chǎn)品說(shuō)明書中針對(duì)【預(yù)期用途】、【樣本要求】、【檢驗(yàn)方法】、【檢驗(yàn)結(jié)果的解釋】及【檢驗(yàn)方法的局限性】等項(xiàng)目增加了有關(guān)腫瘤個(gè)體化治療相關(guān)基因突變檢測(cè)的特殊說(shuō)明。在【樣本要求】部分對(duì)本類試劑在檢測(cè)過(guò)程中所需樣本的特殊要求及對(duì)樣本處理過(guò)程的質(zhì)量控制進(jìn)行了明確,在【檢驗(yàn)方法的局限性】部分,專門對(duì)由于非試劑原因造成的假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果進(jìn)行了可能性的分析。

(二)主要原材料的研究資料中包含內(nèi)對(duì)照。

內(nèi)對(duì)照(內(nèi)標(biāo))可以對(duì)管內(nèi)抑制導(dǎo)致的假陰性結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制,尤其是靶核酸為RNA、用于基因重排或基因表達(dá)異常等檢測(cè)目的時(shí),可以采用管家基因或與靶基因濃度水平相當(dāng)?shù)钠渌蛐蛄凶鳛橄鄳?yīng)的內(nèi)對(duì)照(內(nèi)標(biāo))。申請(qǐng)人應(yīng)對(duì)內(nèi)對(duì)照(內(nèi)標(biāo))的引物、探針和模板濃度做精確驗(yàn)證,既要保證內(nèi)標(biāo)熒光通道呈明顯的陽(yáng)性曲線又要盡量降低對(duì)靶基因檢測(cè)造成的抑制而導(dǎo)致假陰性。

(三)明確提出對(duì)樣本核酸分離純化的要求。

樣本核酸的分離/純化主要有以下目的:富集靶核酸濃度、保證靶核酸序列的完整性、增加PCR模板溶液均一性、去除PCR抑制物,樣本核酸分離/純化是決定后續(xù)核酸擴(kuò)增過(guò)程成敗的要素之一。尤其是石蠟包埋組織樣本在福爾馬林固定過(guò)程中,會(huì)使樣品中的核酸與核酸之間,核酸與蛋白之間發(fā)生交聯(lián),并且樣本在不當(dāng)?shù)谋4鏃l件下容易造成核酸的片段化或降解,增加了核酸分離/純化的難度。因此,無(wú)論申報(bào)產(chǎn)品是否含有核酸分離/純化的組分,企業(yè)都應(yīng)對(duì)核酸分離/純化的環(huán)節(jié)做充分的驗(yàn)證。除最大量分離出目的核酸外,還應(yīng)有相應(yīng)的純化步驟,盡可能去除PCR抑制物。常見(jiàn)的核酸分離純化均有其優(yōu)勢(shì)和不足,申請(qǐng)人應(yīng)結(jié)合申報(bào)產(chǎn)品的特性,合理選擇核酸分離/純化試劑,并提供詳細(xì)的驗(yàn)證資料。

(四)分析特異性包括野生型驗(yàn)證和交叉反應(yīng)兩部分,前者為采用不同濃度的野生型核酸樣本進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果應(yīng)為陰性。后者主要包括以下兩個(gè)方面,其一,申報(bào)試劑所覆蓋的全部突變類型間的交叉反應(yīng);其二,核酸序列相近或具有同源性、易引起交叉反應(yīng)的野生型或其他突變類型序列間的交叉反應(yīng)。申請(qǐng)人應(yīng)提供所有用于交叉反應(yīng)驗(yàn)證的突變或野生型序列來(lái)源、序列確認(rèn)和濃度選擇等試驗(yàn)資料。有關(guān)交叉反應(yīng)驗(yàn)證的信息應(yīng)在產(chǎn)品說(shuō)明書的【產(chǎn)品性能指標(biāo)】項(xiàng)中有所體現(xiàn)。

(五)陽(yáng)性/陰性參考品。

如申報(bào)產(chǎn)品有相應(yīng)的國(guó)家參考品,則企業(yè)內(nèi)部陽(yáng)性/陰性參考品應(yīng)參考國(guó)家參考品的項(xiàng)目設(shè)置。在不低于國(guó)家參考品要求的前提下,申請(qǐng)人可以結(jié)合實(shí)際情況設(shè)置合理的企業(yè)內(nèi)部陽(yáng)性/陰性參考品。對(duì)于沒(méi)有國(guó)家參考品的產(chǎn)品,申請(qǐng)人應(yīng)根據(jù)產(chǎn)品性能驗(yàn)證的實(shí)際情況自行設(shè)定企業(yè)內(nèi)部參考品,應(yīng)著重考慮試劑盒(分型或不分型)所能覆蓋的所有突變位點(diǎn)均應(yīng)設(shè)置相應(yīng)的陽(yáng)性參考品,每個(gè)突變位點(diǎn)設(shè)置至少三個(gè)突變百分率梯度,其中需包括至少一份弱陽(yáng)性參考品。陽(yáng)性參考品的突變形式及濃度需經(jīng)過(guò)金標(biāo)準(zhǔn)方法或已上市同類分型試劑的確認(rèn)。

(六)臨床試驗(yàn)參比方法的選擇可以是境內(nèi)已批準(zhǔn)上市、臨床普遍認(rèn)為質(zhì)量較好的同類產(chǎn)品作為參比試劑,也可選擇核酸序列測(cè)定方法作為此類試劑臨床試驗(yàn)研究的參比方法。此外,在充分考慮檢測(cè)結(jié)果具有明確可比性的前提下,也可以選擇熒光原位雜交(FISH)或免疫組化等染色體或蛋白水平的檢測(cè)技術(shù)作為參比方法,但考慮到檢測(cè)結(jié)果之間不具有直接的可比性,建議對(duì)所有陽(yáng)性病例采用其他分子生物學(xué)技術(shù)(如核酸序列測(cè)定)對(duì)結(jié)果予以確認(rèn)。測(cè)序部分資料的提交參考上一條要求。

(七)病例選擇及陽(yáng)性病例比例。臨床試驗(yàn)應(yīng)以腫瘤患者為研究對(duì)象,其中試劑盒規(guī)定范圍的每種突變類型均應(yīng)有一定量的陽(yáng)性病例。對(duì)于陰性病例的選擇,也應(yīng)考慮到交叉反應(yīng)驗(yàn)證的需要,以從臨床角度考察其分析特異性。陰/陽(yáng)性病例均應(yīng)覆蓋所有適用的腫瘤類型。若產(chǎn)品適用于多種樣本類型,則應(yīng)對(duì)所有樣本類型均進(jìn)行臨床驗(yàn)證。

四、編寫單位

國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局醫(yī)療器械技術(shù)審評(píng)中心。

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